ראש הממשלה בנימין נתניהו התייחס לפרסומים החדשים אודות מכרז הספינות ב"פרשת הצוללות", וטען כי שרבוב שמו לפרשה הוא חלק מקמפיין פוליטי שנועד להדיחו. בפוסט בחשבון הפייסבוק שלו, כתב נתניהו כי "בערב שמחת תורה מוחזרה כתבת שער נגדי עם טענות של בוגי יעלון שכבר הופרכו על ידי פרקליט המדינה, (שאמר שוב לפני ימים אחדים שרה״מ אינו קשור בשום צורה לפרשת כלי השיט ואינו חשוד בדבר)".  נתניהו גם הוסיף כי "אם באמת היו בודקים את העובדות, הם היו מגלים שביטול המכרז עליו מדבר יעלון נעשה על פי בקשה בכתב של... משרד הביטחון בראשות בוגי יעלון! זהו אותו בוגי שאמר שבוע לפני שנאלץ לוותר על תיק הביטחון בנסיבות פוליטיות, שיש לנו ראש ממשלה מצויין".