גורמים במשטרה מציינים כי "עו"ד מולכו הוא שותפו של עו"ד שמרון, הוא קרוב משפחתו ושניהם מקורבים מאד לראש הממשלה. מספיקה שיחה ביניהם לקדם עסקאות גדולות וזה מה שהחוקרים מנסים לפצח. הוא ידע שעו"ד שמרון מטפל בעסקת הצוללות אבל לא דיווח על כך ואנחנו רוצים לדעת מי מהשניים נהנה מאותה קרבה. ברור לנו שגנור ביקש ממנו עזרה ויש כאן לא מעט מהלכים שהתבצעו בחדרי חדרים".
לפי המשטרה השניים יצטרכו להגיע עוד מספר פעמים לחקירות ורק לאחר מכן תיבחן סוגיית מעורבותו של ראש הממשלה. השניים חשודים בעבירת הפרת אמונים. שמו של מולכו עלה במסגרת איסוף הממצאים והעדויות של חוקרי היאל"כ, שקיבלו את ההחלטה לחקור גם אותו כמעורב בפרשה.
ביום שני נערך עימות בין עד המדינה בפרשה, מיקי גנור, לבין פרקליטו, עו"ד שמרון. מולכו, מצדו, טען בחקירותיו כי לא היה מעורב כלל בעסקת הצוללות אולם במשטרה הטיחו בו טענות קשות בניסיון לקבל פרטים בהקשר לעובדה שכיהן כשליח של ראש הממשלה במדינות שונות בעולם וזאת בשעה שהוא נמנה כשותפו במשרד של עו"ד שמרון ועל כך היה אמור לכאורה להעביר דיווח.