העיתונאי יעקב אחימאיר התייחס הבוקר בשיחה לגלי צה"ל, לפרשה 2,000, בה נחקרו ראש הממשלה בנימין נתניהו ומו"ל ידיעות אחרונות, נוני מוזס: "צריך לשאול הבוקר לעוד איזה שפל יכולה לרדת מידת האמון של הציבור, ציבור של מיליונים, של קוראי עיתונים, ועוד לאיזה שפל יכולה לרדת מידת האמון הזאת".
עוד הוסיף אחימאיר: "דורון ירון, העורך של ידיעות אחרונות כתב הבוקר שאין שום בעיה ב'ידיעות אחרונות', הוא באמת חושב שמישהו יכול להאמין לו הבוקר הזה? שכל מה שמתפרסם ב'ידיעות אחרונות' הוא על קנה מידה אתי, מקצועי של העיתונות? הצמרת של ישראל מתפארת בזה שישראל דמוקרטית ושישראל חופשית, איזה קשקוש".
התרעות פיקוד העורף