היוזמה החדשה מעוררת מתיחות עזה בתוך קהילת המודיעין. בכיר לשעבר ב-CIA ציין בעוקצנות כי "רקוזן פשוט רוצה לבנות CIA משלו בתוך הפנטגון". בלאנגלי, מטה סוכנות הביון, התגובה למהלך של משרד ההגנה קרירה במיוחד. ה-CIA מתנגד באופן מסורתי לכניסת סוכנויות אחרות לטריטוריה המובהקת שלו בתחום הריגול האנושי, ומתעקש שמאמצים אלו יתואמו תמיד תחת ראש תחנת ה-CIA במדינה הרלוונטית.
המהלך של הפנטגון מתרחש במקביל לדעיכתה של תוכנית הכיסוי העמוק של ה-CIA עצמו. דו"ח פנימי חשף לאחרונה כי כ-75 אחוזים מסוכני הכיסוי העמוק של הסוכנות צפויים לפרוש עד אמצע העשור הנוכחי, ואין די סוכנים חדשים שיוכלו למלא את מקומם, זאת לאחר שתוכניות התרחבות היסטוריות קרסו בעבר בשל ניהול כושל.
למרות התוכניות השאפתניות, לפנטגון עצמו יש היסטוריה עמוסה בקשיים בהפעלת מרגלים תחת מסווה עמוק. סוכנות הביון של משרד ההגנה, ה-DIA, ופיקוד המבצעים המיוחדים המשולבים, ה-JSOC, התנסו בעבר במבצעי כיסוי מסחריים, עם תוצאות מעורבות למדי. באחד המקרים הזכורים לאחר פיגועי ה-11 בספטמבר, קבוצת סוכני JSOC שפעלה באפריקה תחת מסווה של עובדי חברת כרייה, נחשפה כמעט לחלוטין כשהחלה לשוחח עם גיאולוגים אמיתיים שהבחינו מיד בחוסר הבנתם המקצועית של הסוכנים. מעבר לכך, אתגרי הכיסוי של הפנטגון הולכים ומתרבים בעידן הדיגיטלי, בו אמצעים ביומטריים ורישומי שירות צבאיים מקשים מאוד על שמירת זהויות בדויות ואנונימיות.
מבחינה משפטית, הסמכויות תחתן תפעל התוכנית החדשה נותרו מעורפלות. בעוד שסוכנויות ביון מסורתיות כמו ה-CIA פועלות תחת "סעיף 50" המאפשר איסוף מודיעין ופעולות חשאיות זרות, הצבא האמריקני פועל תחת "סעיף 10", המאפשר הכנה מודיעינית של שדה הקרב, מונח שלעיתים מפורש באופן רחב.
התרעות פיקוד העורף