במאי 2002 פיקד בוכריס על מבצע לאיתור מעבדות נפץ ולכידת מבוקשים בשכם. במהלך הפריצה לבית, נהרג מפקד פלוגה בגדוד, ובוכריס נפצע באורח קשה מאוד, לאחר שנפגע מארבעה קליעים, אחד בכל ירך, אחד בבטן ואחד בכף יד שמאל. על הקרב הזה שבו נפצע קשה והשתקם העניק לו הרמטכ"ל דאז שאול מופז צל"ש.
לאחר תקופת שיקום חזר לשירות קרבי ומונה בספטמבר 2003 למפקד יחידת אגוז. מאז קודם בוכריס בציר הפיקוד ועבר דרך התפקיד שעליו חלם - מפקד חטיבת גולני. בספטמבר 2012 נקרא כאמור על ידי גנץ לתפקיד הגדול בקריירה שלו, כשהועלה לדרגת תת אלוף ומונה למפקד אוגדת הבשן בפיקוד הצפון. רק לפני שלושה חודשים החליטו הרמטכ"ל ושר הביטחון לקדם את תא"ל בוכריס לראש חטיבת המבצעים באמ"ץ. כעת, לאחר החשדות שהועלו נגדו, ייאלץ תא"ל בוכריס קודם כל להילחם על חפותו ורק אחר כך לחזור לקריירה הצבאית שלו.
התרעות פיקוד העורף