במשרד החינוך, לעומת זאת, ביקרו את החלטת משרד המורים ואמרו לפני הדיון כי "ארגון המורים בוחר לפגוע באופן שיטתי, קבוע ושרירותי במערכת החינוך. הוא לוקח בשבי אלפי מורים ותלמידים ורק בשל מאבקים פנים ארגוניים על רקע של כוח ושליטה. משרד החינוך מבהיר כי הלימודים בחטיבות הביניים מתקיימים כרגיל ותלמידים מתבקשים להגיע לבתי הספר. משרד החינוך פונה לבית הדין", כאמור, בית הדין קיבל עמדה זאת.
מארגון המורים לא נמסרה תגובה לפסק הדין.
התרעות פיקוד העורף