במהלך החקירה התבררה מעורבותם של החשודים במיוחס להם ובשורה של אירועי תקיפה נוספים, בהם תקיפות אלימות וחמורות של בני מיעוטים בחמש הזדמנויות שונות, שהחמורה בהם היתה פיגוע דקירה לפני כחודשיים, והשחתת רכב של בן מיעוטים בנוסף נאספו בחקירה ראיות נוספות, נסיבתיות וישירות, אשר קושרות את החשודים לביצוע המעשים.
חקירתם של המעורבים חשפה פרטים רבים אודות פעילותם, ובמסגרתה נתפסו כלים ששימשו למעשי התקיפה, בהם מספר רב של סכינים קפיציות, אלות ומוטות ברזל. החקירה חשפה כי אירוע התקיפה בוצעו ממניע לאומני-גזעני, במטרה ״למנוע התבוללות של יהודיות עם ערבים בבאר שבע". עוד עלה בחקירה, כי טרם ביצוע התקיפות, נקטו החשודים בפעולות שונות כדי לוודא כי אכן מדובר בבני מיעוטים.
היום הגישה פרקליטות מחוז דרום כתבי אישום נגד השישה לבית המשפט המחוזי בבאר שבע, בין היתר בעבירות שהן "מעשה טרור", בהתאם להגדרתו בחוק המאבק בטרור. הצעירים תושבי באר שבע, סיפרו על חקירות ארוכות וקשות במתקני השב"כ במשך ימים ארוכים. על פי הסנגורים, לפחות אחד מהנערים ניסה תוך כדי החקירות לשים קץ לחייו, וזאת ככל הנראה בעקבות לחצים קשים שעבר.
עו"ד אביחי חג'בי הוסיף כי "דומה כי זכויות עצורים בסיסיות נחסמות בדלתות הברזל של מרתפי השב"כ. חקירת מרשי נעשתה תוך פגיעה והפרה של כל זכות בסיסית שמקנה לו החוק תוך שנמנע ממני להיפגש ולשוחח עימו. בימים הקרובים נחשף לחומר החקירה ונשיב לחשדות בדרכים המקובלות".
התרעות פיקוד העורף