שר הביטחון בממשלת אולמרט הכחיש כי טען שדחיית התקיפה תוביל לתקיפתו כשהוא פעיל. "מייחסים לי הרבה דברים. טיפשות זה לא אחד מהם. מה שהיה אצל אולמרט התנהלו ישיבות קבינט, קצת היסטריות, אני מוכרח לומר", אמר ברק. "'מה יהיה? אסון. הכור הולך להיות חם'. ואני, היות שאני לא אוהב את ההיסטריה הזאת, אני לא אהבתי אותה אצל אולמרט, לא אהבתי אותה שנים יותר מאוחר אצל ביבי, אני הייתי יותר קיצוני מביבי לגבי איראן, אבל תמיד הייתי מרגיע אותו, גם בדיונים בפנים וגם לא פעם בחוץ".
שר הביטחון לשעבר הגיב גם לטענה כי במהלך ישיבת קבינט הוא מנע מראש אגף התכנון בצה"ל, האלוף עידו נחושתן, מלהקריא מצגת בעניין ואמר לו לשתוק. "לפי דעתי, זו יוזמה שיצאה מאולמרט, ראש אג"ת בתמימותו אני מניח, העריך שזה דבר לגיטימי, והכינו שם את הערכת המצב הזו שתומכת בהחלטה שצריך מיד לפעול", אמר ברק. "הדבר החריג ונעדר התקדים הוא שיש הערכת מצב של אג"ת בנושא מבצעי קונקרטי שמובאת אל שולחן הקבינט מבלי שהיא עברה קודם את המסננת הזאת של דיון אצל הרמטכ"ל ודיון אצל שר הביטחון. אבל מה שאמרתי לו 'שב' אין חיה כזו במדינת ישראל".
ברק הוסיף: "זה לא פרוצדורה, זו מהות. אין דבר כזה עמדת אג"ת בקבינט. אני לא יודע, אבל זה לא הוצג כעמדת צה"ל. זה הוצג כבעודה שהייתה באג"ת. לא הייתי בשום ישיבת קבינט שהאלוף איזשהו הציג פתאום עמדה ישירות לממשלה, שלא עברה את הרמטכ"ל ואת שר הביטחון".
הרמטכ"ל לשעבר הכחיש את טענת אולמרט כי מערכת הביטחון הציעה לו להכין את העורף למקרה של מתקפה בדרך שמנועה מפרסום בתקשורת. "תשמע, האיש הזה ירד מהפסים כנראה לפני שלוש שנים. אני חשבתי שהוא ירד (מהפסים) עכשיו בכלא או כתוצאה מהשהייה הארוכה מדי עם הקרצופים של הרצפות בתורנות", אמר ברק. "כנראה שהיסודות האלה של האישיות היו כבר קודם. הזוי, הזוי ומדומיין כמו יותר מדי דברים. אני אומר את זה בעצב מסוים, ומבקש ממך להכניס את זה לתוך הטקסט שישודר".
ברק הגיב גם לטענת אולמרט כי שר הביטחון לשעבר אמר לו שעוזריו מדליפים מידע כנגדו בנושא תקיפת הכור. "זו פשוט יצירה...המצאה גמורה של אדם .. תזמינו את איך קוראים לו? יורם יובל (פסיכיאטר). תעשה איתו תוכנית על אולמרט ואולי תפענח משהו", אמר. "אני באמת קטונתי. אדם מבוגר שנחשף לדברים האלה אמר לי: 'זה מה שקורה כאשר חפיפניק עם תעודות שמעולם לא תכנן מבצע, לא השתתף במבצע ולא פיקד על מבצע, נפגש עם בן אדם שזה מה שהוא עשה כל החיים'".
"דעתי על אולמרט היא שהוא מעולם לא היה ראש ממשלה באמת. הוא היטיב לשחק את התפקיד. היא נשארת קבועה יחד עם זה הרי הוא כיהן כראש ממשלת ישראל. אני חושב שבהחלט מגיע לאהוד אולמרט קרדיט. הוא בסופו שלדבר עמד בראש המערכת הביצועית בזמן השמדת הכור", סיכם ברק.
התרעות פיקוד העורף