יש לציין כי החקירה בפרשת 4,000 נוהלה בידי צוות משותף של חוקרי היאל"כ בראשותו של תנ"צ אלי אסייג, וחוקרי ני"ע , בעוד את פרשת 2,000 ניהלה יאח"ה בראשותו של תנ"צ כורש בר נור, כך שהמשטרה תתבקש לצרף צוות מהיאח"ה לצוות המנהל את תיק 4,000.
במהלך חקירת תיק 4000, בו נחתמו הסכמי עדי מדינה עם שלמה פילבר, מקורבו של נתניהו ומנכ"ל משרד התקשורת וכן עם ניר חפץ יועצו של ראש הממשלה ואחד ממקורבי משפחתו , נחשפו לכאורה פלטפורמה זהה ומאפיינים שחזרו על עצמם בשתי הפרשות מה שהעלה חשד לדפוסי התנהגות בעייתיים כביכול.
בעוד בפרשת 2000 נשמעו בבירור שיחות שניהל ראש הממשלה עם מוזס במהלכן ביקש סיקור אוהד בתמורה לסייע בצמצום הפצתו של החינמון ישראל היום וקידום החוק שירע עם העיתון כביכול, בפרשת 4,000 ניכרת התנהלות דומה בשעה שתמורת הטבות מפליגות שניתנו לשאול אלוביץ', מבעלי השליטה בבזק וכן באתר וואלה, דרשו בני משפחת נתניהו כביכול סיקור אוהד לראש הממשלה ולרעייתו.
בחקירתם של שרה נתניהו ובנם יאיר, לא מכחישים השניים כי ביקשו לדאוג לכאורה לראש הממשלה באמצעות קשריהם עם בני הזוג אלוביץ' וכן עם יועץ התקשורת חפץ שהפך לשמש כעד מדינה.