כבר בראשיתה של החקירה לבירור נסיבות האסון, וזאת חרף הנטען כי לא קיימות הנחיות בכל הקשור ליציאה לטיולי גיבוש במסגרת מכינות צבאיות, החליט צוות החקירה המיוחד לעצור את המדריך ברדיצ'ב וכן את מנהל המכינה כאהן, בחשד לגרימת מוות ברשלנות ושיבוש מהלכי חקירה. כבר בשלב הראשוני של החקירה עלתה בשיחות סגורות האפשרות לפיה ברדיצ'ב התעלם מההתרעות שהופנו אליו, ומתחזיות מזג האוויר שהופנו אליו ואשר הורו על סכנה ממשית לשלום התלמידים באם יצאו לטיול.
בפרקליטות סברו כבר אז כי יש לפתוח בחקירה בחשד לעבירת הריגה, אולם במשטרה ציינו כי תחילה יש לאסוף ראיות ולהתבסס במיצוי החקירה, מה גם שבסופו של דבר ההחלטה הינה בחזקתה של הפרקליטות. כאמור החקירה נפתחה בחשד זהה לשני החשודים ויוחסו להם עבירות של גרימת מוות ברשלנות ושיבוש מהלכי חקירה. כבר מראשיתה של החקירה עלו סתירות בעדויות של השניים שהטיחו את החשדות האחד כנגד השני.