לגבי יעקב נגל, מי שהיה ראש המל"ל תחת נתניהו וממשיך לייעץ למשרד ראש הממשלה בנושאים שונים גם לאחר שסיים את תפקידו אמר השופט מזוז: "ראש המל"ל עובד באופן צמוד וקבוע עם רה"מ. אם זה היה הדבר היחיד, הוויכוח היה אם חלוף שנה היא תקופת צינון מספקת. אבל אנחנו יודעים שנגל המשיך לתת שירותים לרה"מ, מקצועיים כמובן, אבל נשאר קשור לממשלה ולרה"מ גם אחרי שסיים לשמש ראש המל"ל. האם הוא נציג ציבור או נציג הממשלה?".
באשר למינויה של רו"ח איריס שטרק, שנגדה עלו חשדות לקרבה פוליטית לשרים, כמו גם לראש הממשלה נתניהו אמר השופט גרוסקופף "זו ועדה שבאה לבחון את טוהר המידות, לא להמליץ על מועמדים. האם אפשר למנות לוועדה מישהו שאפילו לשיטת הפרקליטות אי אפשר להגיד שהיא ללא רבב? האם היא תוכל לקבוע אם דבק רבב במועמדים אחרים?".
בית המשפט הורה למדינה לנמק תוך חודש מדוע לא יוסר מינויים של שטרק ונגל מחברות בוועדה. מפרוטוקול הדיון עולה כי השופטים סבורים כי אין מקום להמשך הישארותם כחברים בוועדה אך מעניקים למדינה זמן לחשב את צעדיה. עד אז הוועדה שצפויה לדון במינוי המפכ"ל והרמטכ"ל מוקפאת
התרעות פיקוד העורף