עוד דווח, כי שר הביטחון מהחלטתו של ראש הממשלה, משום שצה"ל מתנגד לעסקה וזאת מאחר שאין צורך בצי צוללות כה גדול. בנוסף, בשיחה בין נתניהו ליעלון, שלדברי מקורבים, "היתה קשה", אמר ראש הממשלה כי חייבים להשלים את העסקה כל עוד קנצלרית גרמניה אנגלה מרקל נמצאת בתפקיד, משום שמי שיחליף אותה אולי לא ירצה לחתום עליה.
עם זאת, בצה"ל החליטו שנושא הצוללות יהיה נחלתה של הממשלה, משום שעל פי פרסומים זרים הן מסוגלות לשגר נשק גרעיני ומהוות אפשרות "מכה שנייה", והכוונה היא שתהיה נוכחות של צוללות בים בכל עת, מה שמצריך צי גדול.
מנגד, תומכי העסקה טוענים כי ההנחה שמעניקה ממשלת גרמניה גם על הצוללות החדשות הללו (30%) הופכת את העסקה לכדאית ביותר עבור חיל הים הישראלי. לדבריהם, "הגרמנים ייתנו לנו מה שאף אחד אחר לא ייתן בתחום הצוללות, וזה כבר הוכח". טיעון נוסף הוא שעדיף שכל הצוללות שמחזיק חיל הים הישראלי יהיו מאותו יצרן, מה שיקל על האחזקה והלוגיסטיקה.
הטענות הללו לא משכנעות את המבקרים: ישראל מבצעת את העסקאות הללו בדרך חובבנית, ובמקרה הזה אכן יש לא מעט אופציות כדאיות יותר שישראל כלל לא טרחה לבדוק, אמרו הגורמים ל"מעריב־סופהשבוע", מדובר במחיר מופקע ובהנחה פיקטיבית, שניתנה על מחיר גבוה מלכתחילה.
מסביבתו של ראש הממשלה נמסר כי העסקה היתה על דעת שר הביטחון לשעבר וכי שתי הספינות לא יירכשו בסופו של דבר.
התרעות פיקוד העורף