הממשלה הפלסטינית הזהירה מפני "המהלכים חסרי התקדים במסגד אל-אקצה", בעקבות הפיגוע. "יש להפסיק לאלתר את ההתנכלות ולפתוח את המסגד, כדי לא לפגוע בקדושתו", אמר דובר הממשלה יוסף אל-מחמוד. "הממשלה עוכבת בדאגה אחר המהלכים של הכיבוש, שעלולה לפגוע במעמד ההיסטורי והסטטוס קוו במסגד אל-אקצה ובמזרח ירושלים הכבושה, דבר שיביא להידרדרות נוספת במצב הנפיץ".
אחרי הפיגוע הקשה: הר הבית ייפתח בהדרגה, תוך אבטחה כבדה
באתר הקדוש בוצעו חיפושים בהיקף חסר תקדים. בין היתר, שוטרים נכנסו למשרדים ומצאו בהם אמצעי לחימה ותכנים מסיתים. בכניסה להר הוצבו מגנומטרים, מצלמות אבטחה יותקנו במקום
התרעות פיקוד העורף