מפקד בית הספר הוא קצין חיל האוויר בדרגת סא"ל ויש גם אנשי סגל צבאי הכפופים לו. אולם את מרבית התוכן מעבירים מרצים אזרחים, כ־15 במספר, המועסקים על ידי המכללה למינהל ומעבירים תכנים בבית הספר, בעיקר מתחומי הייעוץ הארגוני והפסיכולוגיה. עוד לפני שנכנס לתפקידו חשד מפקד בית הספר שהמקום התנהל באופן שאינו תקין, ודיווח על כך לבכירים בחיל האוויר. הללו דיווחו למצ"ח ובחודשיים האחרונים מתנהלת חקירה בנושא, ובעקבותיה הופסקה ההתקשרות עם המכללה למינהל. כעת בית הספר עובד במתכונת מצומצמת.
חשד להונאה בבית הספר למנהיגות של חיל האוויר: מרצים קיבלו שכר בלי ללמד
מצ"ח חוקרת אי־סדרים במוסד. בעקבות החקירה בית הספר פועל במתכונת מצומצמת, לאחר שהופסקה ההתקשרות עם המכללה למינהל
התרעות פיקוד העורף