הדברים של ראש הממשלה בדבר ההוראה כי צה"ל נדרש להפיל את המשטר באיראן ולמנוע את פרויקט הגרעין באיראן זכו לביקורת בתוך צה"ל ומערכת הביטחון, שהסבירו כי מטרות המלחמה שמציב ראש הממשלה הן אינן ברות השגה לשום צבא. בצה"ל ובמערכת הביטחון אומרים שצה"ל יכול להחליש את המשטר באיראן ויכול לערער את המשטר אבל לא להפיל אותו. לשם כך נדרש מהלך נוסף מדיני או ציבורי בתוך איראן. גם בענין הגרעין, בצה"ל אומרים שההשפעה הצבאית האפשרית מוגבלת - צה"ל יכול לעקב את הפרויקט אבל לא למנוע אותו לחלוטין.
הביקורת בצה"ל חילחלה גם לדרג הפוליטי. ההתקפה הבוקר כ"ץ על גוש השינוי הוא מהלך של מצוקה. כ"ץ מבין שחמישה ימים לפני הבחירות הוא לא יכול ללכת חזיתית מול הרמטכ"ל, צה"ל וכל מערכת הביטחון כי אז הוא יפסיד את מהיצר המנדטים שנותרו לליכוד. האופציה שנשארה לישראל היא לירות את התחמושת על ראשי המפלגות: איזנקוט, ליברמן, בנט, לפיד וגולן.