חבר הכנסת אראל מרגלית, המועמד לראשות מפלגת העבודה, אמר כי "תחת אורי אריאל, ישראל הפכה למדינת כל מתנחליה. דוח המבקר מוכיח לכל מי שלא רצה להאמין איך הממשלה הזו בוזזת את הפריפריה ואיך הימין הפקיר את הנגב והגליל. ממשלת ישראל משתמשת בכסף שמיועד לכל אזרחי המדינה כדי להשליך אוכלוסיות שאינן מקורבות לצלחת".
מנגד, חבר מפלגתו של השר אריאל, חבר הכנסת בצלאל סמוטריץ', תקף את מבקר המדינה וטען כי הוא "מבקר המדינה הפוליטי ביותר בתולדות המדינה. הפעם בשירות השמאל הקיצוני נגד הציבור הדתי והמפעל המפואר של הגרעינים התורניים".
לדברי סמוטריץ', "הפרק בדוח מבקר המדינה העוסק במפעל הגרעינים התורניים הוא אחד המוטים והפוליטיים ביותר שנכתבו כאן מאז קום המדינה. יותר ויותר פעמים בזמן האחרון נופל המבקר בפח ומשמש כלי ניגוח בידי צד פוליטי אינטרסנטי כנגד צד פוליטי אחר. על הדרך הוא גם מנסה לסרס עוד ועוד את יכולתו של הדרג הנבחר לקבוע את מדיניותו ולממש אותה".
לטענת חבר הכנסת, "נדמה שהמבקר עובד אצל סתיו שפיר ואצל ארגון השמאל הקיצוני 'מולד', שהדוח כולו מבוסס על מניפסט מוטה וחובבני שהוציא הארגון בדצמבר 2014 - חודשיים בלבד לפני שהמבקר החל בבדיקתו. החגיגות התקשורתיות של ארגון השמאל הקיצוני הזה היום עם פרסום הדוח מוכיחות את שילוב הידיים הזה יותר מכל".
התרעות פיקוד העורף