כמו כן, השניים גם דנו בעסקת הגרעין מול איראן, כאשר במסגרת זו הזהיר נתניהו כי "אם העסקה לא תשתנה, אז בתוך שמונה עד עשר שנים יהיה לאיראן ארסנל של נשק גרעיני".
לפני כיממה ליברמן ושויגו נפגשו בנפרד, בארבע עיניים, ושוחחו גם הם על טהרן. במהלך הפגישה אמר ליברמן: "אנחנו מתנהלים באחריות ובנחישות. לא נתערב בענייניה הפנימיים של סוריה, אך מצד שני לא נאפשר לאיראן ולחיזבאללה להפוך את אדמת סוריה למוצב קדמי נגד ישראל, ולא נאפשר העברת נשק מתוחכם מאיראן, דרך סוריה ללבנון".
לאחר מכן, השניים עברו גם לפגישה מורחבת יותר, בה נכחו הרמטכ"ל, ראש אמ"ן וראש האגף הביטחוני-מדיני זהר פלטי. בפגישה זו שר הביטחון העלה נושאים רבים, ביניהם המצב בסוריה בעקבות הלחימה במדינה, המעורבות האיראנית בסוריה וניסיונותיה להתבסס בה.
בתוך כך, שר הביטחון הבהיר את המדיניות הקבועה והעקבית של ישראל, לפיה ירושלים לא תאפשר העברה של נשק מדויק לחיזבאללה. הפגישה הוגדרה טובה מאוד על ידי הצד הישראלי.