דבריו של הבכיר בממשלת רואנדה נאמרו בתגובה לאלו של נתניהו, כאמור, שתקף שלשום בחריפות את הקרן, וזאת בעקבות לחץ שהפעילה, לכאורה, על ממשלת רואנדה שלא לקבל מסתננים מישראל. בהודעה בחשבון הפייסבוק שלו, אף הודיע ראש הממשלה כי בכוונתו לפנות ליושב ראש הקואליציה, דודי אמסלם, ולבקש ממנו להקים ועדת חקירה פרלמנטרית לבחינת פעילות הקרן.
בפוסט כתב נתניהו כי"הגורם המרכזי שהפעיל לחץ אירופי על ממשלת רואנדה לסגת מההסכם להוצאת המסתננים מישראל, זוהי הקרן החדשה לישראל", והוסיף כי "הקרן החדשה היא ארגון זר שמקבל מימון מממשלות זרות ומגורמים עוינים לישראל, כמו הקרנות של ג׳ורג׳ סורוס. מטרת העל של הקרן היא מחיקת הצביון היהודי של ישראל והפיכתה למדינת כל אזרחיה, לצד מדינת לאום פלסטינית נקייה מיהודים בקווי 67׳ שבירתה ירושלים".
נתניהו האשים עוד את הקרן החדשה בתמיכה בארגונים אנטי ציוניים, ואף בתמיכה במחבלים. "מזה עשרות שנים הקרן מממנת ארגונים אנטי ציונים ופרו פלסטינים, ביניהם כאלה שמוציאים את דיבתם של חיילי צה״ל כמו 'שוברים שתיקה' ו'בצלם' וכאלה שנלחמים למען מחבלים פלסטינים כמו ארגון 'עדאלה", אמר ראש הממשלה.
מלבד זאת, הוא טען כי הוא "לא מכיר אף דמוקרטיה מערבית, ובמיוחד ארה״ב, שלאורך זמן הייתה מוכנה לסבול פעילות עוינת הממומנת על ידי מדינות זרות, כפי שקורה כאן בישראל עם הקרן מזה עשרות שנים".