המינוי עשוי לעורר בעיות פוליטיות, שכן מאטיס פרש מהצבא רק ב-2013 ולכן נדרש לאישור מיוחד מהקונגרס כדי לקבל תפקיד בפנטגון. עם זאת, בהחלט סביר כי ניסיונו הרב והערכה אליו בעולם הצבאי ימנעו מסנאטורים דמוקרטים להתאמץ למנוע את המינוי.
טראמפ הציג את הבחירה בכנס באוהיו, ואמר כי "גנרל מאטיס הוא הדבר הכי קרוב שיש לנו היום לגנרל פטון", כשהוא מתייחס לג'ורג' פטון, המצביא האמריקאי האגדי שלחם במלחמת העולם השנייה.