עוד דווח, כי פיצוצים עזים נשמעו במרכז המחקר, וכי מערך ההגנה האווירי הסורי שיגר שלושה טילים לעבר המטוסים התוקפים. בדיווח אחד נטען כי מטוסי קרב שיגרו שני טילים, שאחד מהם יורט והשני נפל באזור לא מיושב. סוכנות הידיעות הסורית סאנ״א טענה כי מערך ההגנה האווירי הדף מתקפה ישראלית, והצליח להשמיד שלושה מהטילים ששוגרו בפרברי דמשק. אולם בדיווחי האופוזיציה נמסר, כי הותקף בסיס של ארגון חיזבאללה הלבנוני בסוריה, ונמסר על ״עשרות הרוגים״. עיתון "א-דיאר" הלבנוני ציטט ממקורות סוריים כי ישנם הרוגים ופצועים ב"מתקפה ישראלית".
התרעות פיקוד העורף