בתוך כך, מחריפה המתיחות בין פתח לחמאס על רקע הכינוס הקרוב של המועצה הלאומית הפלסטינית (המתפקד כמעין פרלמנט של אש"ף שמאז עידן הסכמי אוסלו ירד בחשיבותו המעשית) ב-30 באפריל ברמאללה. בראשית מרס החליטה הנהגת פתח בראשות אבו-מאזן לערוך כינוס של הגוף ברמאללה בהרכבו הנוכחי, כלומר ללא נציגות חמאס אשר אינו משתייך לאש"ף. חמאס והג'יהאד האסלאמי קראו לדחיית מועד הכינוס ולשינוי מיקומו כך שיהיה כינוס "מאוחד", כלומר כזה שלראשונה יכלול את נציגיהם, בהתאם להסכמות אליהם הגיעו הצדדים בשיחות בביירות בינואר 2017. בעוד שבפתח נחושים לקיים את כינוס המועצה במועדו ברמאללה, הודיעה ביום ה' האחרון "החזית העממית לשחרור פלסטין", הארגון בעל הנציגות הגדולה במועצה לאחר פתח, כי היא תחרים את הכינוס לאחר שנציגיה לא הגיעו להסכמות עם נציגי פתח בשיחות שקיימו בנושא בקהיר. כמו כן, בימים האחרונים דווח כי חמאס פועל לערוך כינוס לאומי אלטרנטיבי בשותפות עם החזית העממית ועם פלגים נוספים.
המחלוקת סביב כינוס המועצה הלאומית הפלסטינית מצטרפת להמשך המתיחות סביב סוגית הפיוס הלאומי, וסירובו של חמאס להיענות לאולטימאטום שהעביר לו לאחרונה אבו-מאזן, כי אם לא ימסור בפעימה אחת את כלל סמכויות השלטון ברצועה לרשות הפלסטינית, לא יהיה פיוס והרצועה תהיה נתונה לסנקציות חריפות מצד הרשות ותוכרז "כאזור מורד".