בהמשך התברר כי ככל הנראה לא מדובר באירוע חטיפה. לפי המידע שנבדק בישראל, במהלך הטיסה התפתח עימות בין הטייס לטייס המשנה, ובמהלכו הופעל בטעות כפתור המצוקה שהוביל לחשד הראשוני לאירוע ביטחוני. נסיבות האירוע עדיין נבדקות, ובין היתר נבדקת האפשרות שהעימות כלל גם דקירה.
עדות של נוסעת ישראלית שהייתה על המטוס מספקת הצצה לרגעי החרדה שעברו על הנוסעים. בשיחה עם i24news סיפרה מרים: "שמענו צרחות במטוס. לאחר מכן פתחו את תא הטייס, ראו דם, ומישהו דקר את הטייס עם אולר". לדבריה, נוסעים ישראלים סייעו להשתלט על החשוד יחד עם אנשי הצוות. "התפללנו 'שמע ישראל'. הישראלים ניטרלו את הדוקר ביחד עם הצוות שהיה, וכעת נחתנו נחיתת חירום. היו גם רגעים שחשבנו שאנחנו לא יוצאים מזה בחיים". תהילה, שאחותה הייתה על המטוס, סיפרה על רגעי החרדה בזמן שהמשפחה המתינה לעדכון: "ראינו שיש עיכוב של המטוס, עברה עוד שעה והיא לא עדכנה אותנו. אחר כך היא סיפרה שאחד הנוסעים ניסה לרצוח את הטייס ושכולם צעקו 'שמע ישראל'".
נ׳, תושבת קיבוץ בצפון סיפרה לוואלה כי אמה, בת 75, נמצאת על המטוס. היא טיילה בנפאל במשך כשבועיים, עם חברה, והיתה בדרכה לישראל דרך דובאי. בני המשפחה ציפו לאסוף אותה מתחנת הרכבת בלב המפרץ ואז התברר שהטיסה מתעכבת.
״היו רגעי חרדה גדולים מאוד. לא הצלחנו ליצור איתה קשר. מבינים שאין שם קליטה ושכרטיסי הסים שלהן לא מאפשרים ליצור קשר. במצב הביטחוני שישראל נמצאת בו, תרחיש של חטיפה נשמע בהתחלה כמו תרחיש אימים ריאלי. אנחנו מקווים שזה יסתיים בשלום, סומכים על כוחות הביטחון וסומכים על הסעודים ומקווים לשמוע ממנה בהקדם״.
בשלב זה עדיין נבדקות הנסיבות המדויקות בתוך תא הטייס, ובכלל זה זהות המעורבים בעימות, כיצד הופעל אות המצוקה והאם אכן התרחש אירוע דקירה. מה שכבר ברור הוא שאות המצוקה והניתוק מהקשר עם ישראל הובילו בתוך דקות להיערכות ביטחונית חריגה, עד שהתמונה החלה להתבהר לאחר נחיתת המטוס בסעודיה.