"שתי אצבעות מצידון" (1986)
בתחילת דרכו הקולנועית, אלון אבוטבול ז"ל גילם בסרט "שתי אצבעות מצידון" את דמותו של ג'ורג'י, חייל צעיר וחדור מוטיבציה, המשרת במוצב צה"ל בדרום לבנון. הסרט, שביים אלי כהן, מתאר את חיי הלוחמים במוצב מבודד וזכה לשבחים על ריאליזם ותיאור אנושי של שגרת הלחימה. על אף שמדובר בתפקיד משנה, אבוטבול בלט במשחקו האותנטי והמשכנע, שתרם לאווירה המתוחה והאמינה של הסרט. הסרט עצמו זכה בפרס וולג'ין בפסטיבל ירושלים ובפרס כינור דוד, ונחשב לאחד מסרטי המלחמה המשפיעים והחשובים ביותר בקולנוע הישראלי.

אחד משלנו (1989)
בסוף שנות ה-80 הכוכב הישראלי בסרט "אחד משלנו" של האחים ברבש, שבמרכזו הקשר בין שלושה חיילים, שהחברות הקרובה ביניהם עומדת למבחן כשאחד מהם חוקר פרשה של רצח עציר פלסטיני בבסיס שעליו מפקדת דמותו של אבוטבול. השחקן, שהשתתף בסרט לצד שרון אלכסנדר, דן תורן ודליה שימקו, זכה עליו בפרס השחקן הטוב ביותר בפסטיבל ירושלים.

אלון אבוטבול ודליה שימקו בסרט ''אחד משלנו'' (צילום: צילום מסך)

הכוכב הכחול (1995)
באמצע שנות ה-90 כיכב אבוטבול בסרט "הכוכב הכחול" של גור בנטביץ', שמתאר את המסע הסוריאליסטי של מולי - צעיר שהתיק שלו נגנב כשהוא מגיע לתחנה המרכזית הישנה בתל אביב. "הכוכב הכחול" הפך עם השנים לסרט פולחן עם עדת מעריצים הולכת וגדלה, שזכה להקרנות סוערות בסינמטקים שוב ושוב.

שבתות וחגים (1999-2004)
אבוטבול גילם בסדרה "שבתות וחגים" פורצת הדרך את דמותו של רמי משעני, שחקן כדורסל לשעבר הנשוי לליאת (יעל אבקסיס). דמותו של רמי הייתה מרכזית בעלילה, והוא התמודד עם אתגרים אישיים ומקצועיים לאורך עונות הסדרה. על משחקו בסדרה אבוטבול היה מועמד לפרס האקדמיה לטלוויזיה, והסדרה עצמה זכתה בפרס לסדרת הדרמה הטובה ביותר. בריאיון לוואלה! תרבות בשנת 2015 התייחס אבוטבול בגעגועים לתקופה שבה צולמה הסדרה וציין שמדובר בתפקיד ששינה את חייו. על דמותו של רפי אמר: "ביליתי איתו הכי הרבה זמן, איזה שבע שנים מחיי. הוא לימד אותי תוך כדי העשייה שלו. הטוטליות של העבודה".

האסונות של נינה (2003)
סרטו של שבי גביזון זכה להצלחה ביקורתית וקופתית גדולה, וקיבל 11 פרסי אופיר, כולל הסרט הטוב ביותר. אבוטבול גילם בו את דמותו של אלכס, בן זוגה של הגיבורה (איילת זורר), דמות מורכבת ומשמעותית במארג העלילה. הביקורות שיבחו את הופעתו של אבוטבול בסרט, שבו הצליח להעביר באופן אמין את המורכבות הפסיכולוגית של הדמות, ובהתאם זכה בפרס אופיר לשחקן המשנה הטוב ביותר לשנת 2003.

מינכן (2005)
בסרטו של סטיבן שפילברג, המגולל את סיפורם של סוכני המוסד הישראלי שנשלחו לחסל את האחראים לטבח הספורטאים באולימפיאדת מינכן, אלון אבוטבול השתתף לצד קאסט רחב של שחקנים ישראלים ובינלאומיים. בין היתר היו שם משה איבגי, גילה אלמגור ואיילת זורר, בסרט שעורר דיון ציבורי נרחב בישראל ובעולם.

בופור (2006)
אבוטבול גילם בסרט את קמחי, מפקד האוגדה. "בופור" הפך לסרט הישראלי הראשון שהיה מועמד לאוסקר לסרט הזר הטוב ביותר מאז "מאחורי הסורגים" משנת 1984. הסרט גם זכה בפרס "דב הכסף" לבמאי הטוב ביותר בפסטיבל ברלין וכמובן גרף ארבעה פרסים בטקס פרסי אופיר.

עלייתו של האביר האפל (2012)
בשנת 2012 השתתף אבוטבול בסרט ההוליוודי בעל הפרופיל הגבוה ביותר בקריירה שלו - "עלייתו של האביר האפל" השלישי בטרילוגיית באטמן המצליחה של כריסטופר נולאן. בסרט גילם אבוטבול מדען גרעין רוסי בשם ליאוניד פאבל, שנחטף בפתיחת הסרט בידי הנבל, ביין, ונרצח לעיני המוני צופים באצטדיון פוטבול בגותהאם. לצידו השתתף בסרט גם שחקן ישראלי נוסף, אורי גבריאל.

"מקום בגן עדן" (2013)
ב-2013 גילם שיחק אבוטבול בתפקיד ראשי נוסף - "מקום בגן עדן" של יוסי מדמוני, שבו גילם גנרל בכיר עם עבר של פשעי מלחמה, שמוכר את מקומו בגן עדן לטבח עבור שקשוקה. הסרט מתכתב עם שלל סיפורים תנ"כיים, ועוסק בציר שבין חילוניות ואמונה.

הרמון (2018)
אבוטבול גילם בסדרה "הרמון" מנהיג של כת בהשראת כתות כדוגמת הכת של גואל רצון. בריאיון לוואלה תרבות על תפקידו, שאלנו אותו אם הוא יכול להבין את המקום שממנו בא הגבר הדומיננטי ששולט בנשים. "יש דברים שאני יכול להבין. יש ניתוח פסיכולוגי מאד ברור ועם זאת משהו מסתורי. אבל בנאדם שחושב שהמשיח יכול לצאת ממנו, איך מבינים את זה?".

השחקן אלון אבוטבול (צילום: מיכל פתאל, פלאש 90)

ביקור התזמורת (2022)
באחד מתפקידיו הגדולים האחרונים על הבמה, נכנס אבוטבול ב-2022 בווסט אנד בלונדון לנעליו של ששון גבאי בתפקיד האיקוני של תאופיק, ראש התזמורת המצרית, במחזמר על פי הסרט "ביקור התזמורת", לצד מירי מסיקה. המחזמר זכה לשבחי הביקורת, ואבוטבול אף היה מועמד לפרס אוליבייה על תפקידו זה.

הגרמני (2025)
אבוטבול גילם בסדרה "הגרמני" את דמותו של עמוס שפירא, ראש המוסד בשנות ה-70. הסדרה עוסקת במרדף אחר יוזף מנגלה, רופא המוות הנאצי, ומציגה את מאבקי הזהות, הזיכרון והנאמנות של שני ניצולי שואה החיים בקיבוץ בצפון הארץ. בריאיון ל-ynet על תפקידו, אבוטבול שיתף על מורכבות הדמות: "אני קורא לזה נבל בשירות החוק, בשירות הצדק. יש משהו שהוא יותר גדול ממנו אז הוא בעצם לא נבל, הוא איש טוב. אבל מה שהוא עושה יכול להרוס חיים של אנשים כדי לשרת את האינטרסים ה'צודקים' שלו. לשחק על הגבול הזה, להביא את שני הצדדים האלה, זה מאוד מעניין בעיניי. וכשאני משחק אחד כזה ורואה את הסדרה, אני תמיד רואה את אבא שלי, פיזית. הוא נפטר בגיל 65 ואני עוד מעט שם, וככה אני זוכר אותו".

הישראלי שכבש את הוליווד: נפרדים מאלון אבוטבול

מהתפקידים הראשונים בקולנוע הישראלי ועד לסרטי ענק הוליוודיים כמו "מינכן" ו"באטמן": אלון אבוטבול השאיר חותם עמוק במסך המקומי והעולמי, ונפרד מהחיים בגיל 60 בלבד