מהילד בכפר הקטן שלא שמע רדיו ועד לאחד מנגני הסקסופון טנור המובילים באירופה ב-20 השנים האחרונות, הדרך של יונאתה הייתה מחוץ למסלול השגרתי. את הקריירה המקצועית שלו הוא החל רק בגיל 28, גיל מאוחר מאוד בעולם הג'אז, לאחר שנים של חיפוש עצמי וספקות. "בהתחלה רדפתי אחרי וירטואוזיות וטכניקה כמו הגיבורים הגדולים שלי", הוא מספר. "אבל ככל שהתבגרתי, ה'קול' שלי הפך לירי, רגוע ומחפש פשטות. המטרה הפכה להיות גיבוש סאונד חם שמדמה את הקול האנושי. כשאתה מגיע לזה, אתה כבר לא סתם מנגן - אתה מדבר עם העולם".
החזרה הזו לתל אביב, לאחר יותר משש שנות היעדרות, אינה מובנת מאליה. בשנתיים האחרונות, כאשר חלק מקהילת הג'אז הבינלאומית מגלה היסוסים לבקר בישראל בשל המצב הביטחוני והלחצים הפוליטיים, יונאתה בחר להפגין עמדה נחרצת ולא להירתע מקריאות החרם.