יפן הפכה בשנים האחרונות לאחד היעדים המבוקשים ביותר בקרב הישראלים. הסיבות לכך הן היחלשות הין היפני והתחזקות כוח הקנייה של השקל, העובדה שבניגוד לחלק מהאירופים, היפנים ידידותיים מאוד לתייר הישראלי, ולבסוף האטרקציות יוצאות הדופן במדינה.
כניסת ארקיע ליפן תיאלץ את אל-על, שכבר טסה ליעד זה, להוריד מחירים. נזכיר כי מרבית החברות המזרח-אסייתיות כמו אייר אינדיה, למעט האינאן איירליינס, ביטלו את הטיסות לישראל. גם חברת לופטהנזה שבאמצעותה טסו למזרח (בקונקשן דרך פרנקפורט) לא חזרה לטוס לישראל.
הטיסות הישירות לטוקיו יחלו ב-25 באוקטובר ויופעלו פעמיים בשבוע: המראות בימי ראשון אחר הצהריים ובימי רביעי בלילה, וחזרה מטוקיו בימי שני בצהריים ובימי רביעי בערב. הטיסות יופעלו במטוס איירבוס A330 רחב גוף ויכללו מחלקת עסקים, כולל ארוחות שף, ומחלקת תיירים. המחיר לטיסה במחלקת תיירים יעמוד על 750 דולר, והוא נמוך מהמקובל באל-על.
הקו לטוקיו מצטרף לרשת היעדים ארוכי הטווח הכוללת את ניו יורק, בנגקוק והאנוי, לצד היעדים החדשים שעליהם הכריזה החברה לאחרונה: סייגון (הו צ'י מין סיטי), פוקט ובימים האחרונים גם וילנה, בירת ליטא.