המסלול אליו קצר ונוח, כ־3 ק"מ הלוך ושוב, ומתאים לכל המשפחה. בדרך פוגשים נוף מדברי דרמטי, נקיק סלע לבן שמתפתל בין הקירות הסלעיים, ומדרגות עתיקות מהתקופה הרומית שחצובות בסלע - תזכורת לכך שבני אדם עברו במסלול הזה הרבה לפני שהוא הפך לאתר טיולים. ההגעה לבריכה עצמה, אחרי הליכה בנוף שצבעיו הם בין לבן לחום־זהוב, מגיע השיא: מים צלולים וקרירים שאי אפשר לפספס.
הסוד להגעה בקיץ הוא תזמון. כדאי להגיע אך ורק בשעות הבוקר המוקדמות, לפני שהחום המדברי הופך להיות בלתי אפשרי. כדאי להצטייד בכמות מים נדיבה ובכובע. זהו טיול קצר יחסית, אבל גם מהסוג שמשנה את התפיסה של מה שאפשר למצוא במדבר. בסמוך נמצא חניון הלילה של הגן הלאומי ממשית - הח'אן הנבטי, שמאפשר להמשיך לחוות את המדבר גם בשעות הערב והלילה, כשהטמפרטורות יורדות והשמיים מתכסים כוכבים.
הדרך עוברת בין עין יקים ואמת מים עתיקה, לצד בוסתן משוקם ושרידי טחנות קמח שמזכירים שהמקום הזה היה פעם מרכז כלכלי חיוני לאזור - לא רק יעד טיולים. נקודת השיא ההיסטורית היא המבטשה, מתקן ששימש בעבר את תעשיית אריגי הצמר של צפת, ושעדיין עומד על תילו בין הסלעים, שריד מוחשי לעיר שהייתה פעם מרכז אריגה משמעותי. ההליכה לצידו, בין אבני הבנייה העתיקות, מזכירה שהשמורה הזו היא לא רק טבע אלא גם פרק שלם בהיסטוריה של הגליל.
אבל מה שגורם לאנשים לחזור לכאן שוב ושוב הוא עצי הדולב הענקיים שמטילים צל כבד על השביל, ובריכות שכווי הצלולות - נקודת העצירה הטבעית של המסלול. כאן אפשר לשבת עם הרגליים במים, או למי שמעז יותר - לקפוץ פנימה ולהתרענן ממש, ולתת לחום הקיץ להישאר בחוץ. הסביבה השופעת והצללים הכבדים יוצרים תחושה של תחנת מעבר מהמדבר הישראלי הקיצי לעולם אחר - ים־תיכוני, רטוב וירוק.
מי שרוצה למשוך את הביקור ליום נוסף יכול ללון בחניון הלילה הצמוד לשמורה - אופציה נוחה למי שלא רוצה לנהוג בחזרה אחרי יום שלם בטבע, ומעדיף להירדם לצלילי הנחל ולקום בבוקר ישר לעוד סבב הליכה לפני שהחום מתגבר.
לצד המרחצאות עצמם, האתר מציע שביל רפלקסולוגיה ייחודי - הליכה על אבנים מסוגים שונים שמפעילה נקודות לחיצה בכפות הרגליים, ולפי הגישה הרפלקסולוגית, תורמת לשיפור היציבה ולזרימת הדם בגוף. זו תוספת קטנה אבל מעניינת לביקור, למי שרוצה לשלב את חוויית המים בפעילות מודעת קצת יותר לגוף.
עם עליית הטמפרטורות בקיץ, רשות הטבע והגנים הרחיבה את שעות הפעילות באתר כדי לאפשר ביקור גם בשעות הנעימות יותר של היום. בימי רביעי וחמישי אפשר להמשיך להתרחץ במים החמים גם אחרי השקיעה. כשהאווירה משתנה לגמרי - הכנרת והגולן נשקפים ברקע באור הדמדומים, והשילוב בין מים חמימים, נוף קסום ושקט של ערב יוצר חוויה שונה לחלוטין מביקור צהריים רגיל. הגן פתוח בימי רביעי וחמישי עד השעה 21:00, עם כניסה אחרונה לבריכות בשעה 20:00.
הכוכב האמיתי של מג'רסה הוא "המסלול הרטוב" - הליכה של כ־800 מטר ממש בתוך מי הנחל הזורמים, כשהמים מגיעים לפעמים לברכיים ולפעמים אף גבוה יותר, תלוי בעונה ובכמות המים. זו לא הליכה "ליד" מים אלא הליכה "בתוך" מים, וזה הבדל שמשנה לחלוטין את החוויה - במיוחד בימים שבהם החום כבר לא נסבל. בשיא הקיץ, המסלול הרטוב הוא בקלות אחת מהדרכים הכי יעילות להתרענן בלי להזיע בחזרה תוך עשר דקות מהיציאה מהמים.
למי שמעדיף להישאר יבש, או שמגיע עם ילדים קטנים שהליכה בנחל לא מתאימה להם, האתר מציע גם מסלול הליכה רגיל שמאפשר ליהנות מנופי השמורה בלי להירטב. בכל אחת מהאופציות, המבקרים מקבלים נוף פתוח של אפיקי נחל, בריכות טבעיות והמרחב הגדול שנפתח לעבר הכנרת והגולן - שילוב שהופך את מג'רסה ליעד שמתאים לבילוי משפחתי שלם, מהקטנים ביותר ועד ההורים שרק רוצים לשבת רגע במים ולשכוח מהחום.