שלוש החטופות נחתו במרכז הרפואי שיבא ביום ראשון האחרון ואושפזו בבית החולים לילדים שבתל השומר, שם הוקמה מחלקת השבים. כל אחת מהן קיבלה חדר פרטי עם מיטה נוספת למלווה, וחדר נוסף לשהיית המשפחה המלווה. בבית החולים הקפידו על פרטיות מקסימלית, כשזרים ואנשי תקשורת לא הורשו להיכנס לאגף האשפוז.
הטיפול הנפשי כולל שיחות פרטניות עם פסיכולוגיות ופסיכיאטריות, ולעיתים שימוש בטכניקות מתקדמות כמו טיפול קוגניטיבי-התנהגותי (CBT) או EMDR לעיבוד טראומות. גם טיפולים משלימים כמו טיפול באמנות ותנועה משולבים בתהליך השיקום, במטרה לספק ערוץ נוסף להבעת רגשות.
מחר צפויות כידוע להגיע ארבע חטופות נוספות כשעל פי ההערכות בית החולים הבא שיקלוט אותן יהיה בילינסון. מחלקת השבים של המרכז הרפואי בפתח תקווה הוקמה בבניין האשפוז של בית החולים לילדים שניידר, עם 21 חדרים המוקדשים לחטופים ומשפחותיהם.