על פי הפרוטוקול, כל שב ייקלט בבית חולים במתחם נפרד, שיישמר בו דיסקרטיות מלאה וימנע חשיפה תקשורתית. המתחם יכלול חדר לשב וחדר נוסף לפחות לבני משפחתו, ויופעלו בו יחידות קליטה משפחתיות שבהן ישהו עד שבע משפחות בכל מרכז. הכניסה למתחם תותר רק לצוותים רפואיים מורשים, נציגי משרד הבריאות, מנהלת החטופים וגורמי ביטחון.
החטופים השבים יימסרו על ידי הצלב האדום לכוח מיוחד של צה"ל. מיד לאחר בדיקה ראשונית, הם יועברו למתחם רעים, שם יעברו בדיקה רפואית, יוכלו להתגלח ולהתארגן, ולאחר מכן ייפגשו עם בני משפחותיהם.
בהמשך, מסוקי חיל האוויר יעבירו אותם לבתי החולים. "אנחנו ערוכים לכך שבמקרה שחטוף יגיע במצב רפואי קשה - הוא יפונה מיידית במסוק לסורוקה", ציין הגורם. באשר לחללים - הם יוחזרו לאחר מכן, לקראת הצהריים. ייערך טקס קצר בשטח בהשתתפות רב צבאי ומשמר כבוד.