זמן קצר לאחר מכן, בצה"ל דחו את הפרסום. בצה״ל אומרים כי על פי הנוהג בצה״ל, בכל דיון בו משתתפים קצינים בכירים, צה״ל מקליט את השיחות למטרת תמלול ודיוק פרטים בהמשך.
בצה״ל אומרים כי האמריקאים מודעים לכך שצה"ל מקליט את השיחות של הקצונה שלו ומכשירי ההקלטה מונחים לעיני כל באולם הדיונים. בצה״ל אומרים כי הפרסום הבריטי הוא לא יותר ״מקשקוש מקושקש״. על פי גורם צבאי, לא הייתה תלונה או פניה אמריקאית בעניין וצה״ל לא פועל לרגל או להוציא מידע מתוך הנאמר בשיחות הפנימיות של האמריקאים עם עצמם.
צבא ארה"ב סירב להגיב לדיווחים על פעילות המעקב הישראלית. צה"ל מסר בתגובה כי הטענה לאיסוף מודיעין על שותפים בפגישות בהן הוא משתתף באופן פעיל היא "אבסורדית", וכי הצבא מתעד ומסכם פגישות באמצעות פרוטוקולים באופן שקוף ומקצועי, כפי שעושה כל ארגון מסוג זה.
למרות הדיווחים בתקשורת על העברת סמכויות לארה"ב, גורם אמריקני רשמי הבהיר כי ישראל שומרת על השליטה המלאה בהיקף הסיוע הנכנס לעזה. הגורם תיאר את המצב כ"אינטגרציה" שבה הישראלים הם "היד" והמרכז הוא "הכפפה". מומחי לוגיסטיקה אמריקניים שהגיעו למקום גילו כי ההגבלות הישראליות מהוות מכשול גדול יותר מאתגרים הנדסיים, ועשרות מהם עזבו את המקום תוך שבועות ספורים.
לפי מסמכי תכנון של צבא ארה"ב שנחשפו ב"גרדיאן", הפלסטינים מודרים לחלוטין מהמרכז. המסמכים נמנעים מהשימוש במילים "פלסטין" או "פלסטיני" ומתייחסים לתושבים כ"עזתים". ניסיונות לצרף נציגים פלסטינים לשיחות וידאו נותקו שוב ושוב על ידי גורמים ישראלים.
על פי הדיווח בעיתון הבריטי הביקורתי כלפי ישראל, האווירה במקום תוארה כשל "סטארט-אפ דיסטופי", עם שטיחי דשא סינתטי ושימוש במונחים תאגידיים חסרי רגישות, כמו "ימי רביעי של בריאות" לשיקום בתי חולים ו"ימי חמישי צמאים" לשירותי מים וסניטציה.
כעת, תפקידו של המרכז עשוי לדעוך כאשר אנשי צבא אמריקנים רבים שבים לבסיסיהם לאחר סיום משימתם. ועדת חקירה של האו"ם קבעה מוקדם יותר השנה כי ישראל מבצעת רצח עם בעזה, ולמרות התכנונים במרכז, לא ברור כמה מהם ייושמו בפועל בצל הריק הפוליטי והמשך הלחימה.
התרעות פיקוד העורף