הפרשה התפוצצה כשבוע לפני טקס הדלקת המשואות המסורתי ביום העצמאות, שם הדליק נדאף משואה לציון פעילותו למען העדה הנוצרית בישראל, אם כי פעילות זאת, הביאה עליו ביקורת רבה מצד הציבור הערבי בישראל, ביקורת המאשימה את נדאף ואת מדינת ישראל בשימוש ציני בשסע הנוצרי- מוסלמי לצורך "הפרד ומשול". נדאף טען כי מקור התלונה הוא באותם מתנגדים פוליטיים שמנסים לפגוע בו ובפועלו. "אויביי מבית חוצים את כל הגבולות ומגדילים את העלילות וסיפורי הבלהות נגדי" טען נדאף, והוסיף: "מדובר בחייל שהורשע וריצה עונש מאסר בכלא צבאי על השלכת רימון צה"לי במסגרת סכסוך אזרחי, ועל עדות מופרכת כזו מנסים להשחיר את פני? לא יעזור לאיש, לא אירתע ואמשיך לפעול למען גיוס חיילים נוצרים לצה"ל. ואגב, בבדיקות הפוליגרף שערכתי פעמיים שללתי כל הטרדה ויצאתי, כמובן, דובר אמת".
תחקיר ערוץ 2 חשף שיחות שביצע נדאף, עם חיילים שנזקקו לסיועו, הכוללות רמיזות מיניות, ובהן נשמע מבקש טובות הנאה תמורת הבטחה לאישורי כניסה לפלסטינים. לבקשת חדשות 2, הכומר נדאף עשה בדיקת פוליגרף שבה נמצא דובר שקר בשאלות הרלוונטיות העולות מן העדויות ומוצגות בתחקיר.
גם בתגובה לתחקיר, התנגד נדאף לטענות נגדו ואמר "גורמים פליליים בקהילה, יחד עם גורמים שהקנאה בהצלחת מפעל חיי העבירו אותם על דעתם, חברו כדי למנוע ממני לקבל הכרה על תרומתי למען גיוס ערבים נוצריים לצה"ל. גורמים אלה ביצעו פשע מתוחכם נגדי ונגד הפורום והצליחו לייצר מצגי מרמה נגדי באופן שייראו אמתיים כביכול. האמת היא שלא עשיתי דבר כלשהו מהמתואר בכתבה – לא פגעתי מינית באיש, לא ניסיתי לפגוע באיש, ולא פעלתי להסדרת רישיונות לפלסטינים לבוא לישראל. אבל הגורמים העויינים, שלצערי נתתי בהם אמון עד כדי עבודה בקרבתי – ניצלו את האמון והשתלטו על דפי הפייסבוק שלי, ואף על המסרים בפלאפון שלי כדי לכתוב דברי שקר, בשמי כביכול. אלוהים יעניש אנשים אלו על הפגיעה בי, באשתי ובשני בני המשרתים עתה בצה"ל. ערכתי שתי בדיקות פוליגרף אחת אצל המבקר הפנימי של איגוד בודקי הפוליגרף ובמכון פוליגרף נוסף ושתיהן אוששו את דברי האמת שלי. מכיוון שאני בטוח בצדקתי הגשתי ללא כל חשש תלונה במשטרה ואני בטוח שזו תגלה את האמת ותחשוף כי מדובר במזימה נגדי".
למרות טענות אלו שרת התרבות והספורט, מירי רגב, האחראית לטקס הגנה על נדאף והשתתפותו בהדלקת המשואות, אשר לא בוטלה.
התרעות פיקוד העורף