בתשובה נכתב כי לאור מהות המינוי, הדרך בה בחרה פרופסור אמתי להתבטא, הזמן הרב שחלף מאז וכן אופי הקרן ולהסכם שמכוחו הוקמה, עמדת המדינה היא שהחלטת השר שלא לאשר את המינוי חורגת ממתחם הסבירות ו"אינה יכולה להיוותר על כנה". עוד נכתב, כי עמדת המדינה הובאה בפני אקוניס, אולם הוא בחר להתעלם ממנה ולהישאר בהחלטתו. יש לציין כי עמדת הפרקליטות התקבלה לאחר שהיועץ המשפטי לממשלה ופרקליט המדינה בעצמם אישרו את הגשת העמדה החריגה, בה הפרקליטות מגישה עמדה המנוגדת לעמדת השר עליו היא אמורה להגן ולייצג.
על בסיס זה, ועליו בלבד, החלטתי שלא לאשר את ההמלצה למנות את פרופ' אמיתי לנציגת ישראל בקרן הישראלית־גרמנית למדע, מחקר ופיתוח. בניגוד מוחלט לתעמולה השקרית המופצת על ידי השמאל הקיצוני, שתומך בסרבנות, אמיתי לא נפסלה על סמך עמדותיה או דעותיה - אלא על סמך מעשיה. לא פסלתי ולא אפסול מישהו בגלל דיעותיו, גם אם תהום אידיאולוגית פעורה בינינו. במדינה דמוקרטית זכותו של אדם להחזיק בתפיסותיו, לרבות ראייתו את פתרון הסכסוך הישראלי־פלסטיני, גם אם היא הפוכה לחלוטין לתפיסותי הידועות".
התרעות פיקוד העורף