הממשלה מסרה לבג"ץ כי לעמדתה יש לבטל את צו הביניים שמונע את פיטוריו של רונן בר, ראש השב"כ. התגובה הוגשה במסגרת בקשה אותה הגישו משפחות חטופים ומשפחות שכולות על ידי עורך הדין יהודה פואה - במסגרתה התבקש להורות על ביטול הצו.
"מכלל הפרסומים עולה תמונה מטרידה של שימוש פסול במשאבי אחד הארגונים הרגישים ביותר במדינה, תוך טשטוש מוחלט בין סמכות מקצועית לבין שיקולים זרים. מצב זה, שנחשף עתה, יוצר משבר אמון חסר תקדים בין הדרג הממונה לשלטון הנבחר, ומשליך באופן ישיר על ביטחון מדינת ישראל, לרבות על גורלם של החטופים – קרובי המבקשים", כתב פואה בשם משפחות החטופים והשכול ביחס לפרסומים אודות פרשת ההדלפות מהשב"כ.
פואה ביקש מבית המשפט העליון "לבחון מחדש את החלטתו, נוכח שינוי הנסיבות המהותי והמשמעותי, ומתוך תחושת אחריות לאומית. הניסיון להציב את בית המשפט כמעין גורם מגשר בין הדרג הנבחר לראש השב"כ - באמצעים של תצהירים חסויים - חוטא למצב הקיים בפועל, ומקבע מציאות בה ראש שירות חשאי מנצל את מעמדו כדי לפעול נגד הממשלה החוקית".
הממשלה, באמצעות עו"ד ציון אמיר, הביעה תמיכה בבקשת משפחות החטופים והמשפחות השכולות אשר קבלתה תאפשר את פיטוריו המידיים של רונן בר. לדברי אמיר, "הודעת ראש ועדת המודיעין בסנאט, הסנאטור תום קוטון, שניתנה לאחר צו הביניים, על כך שהממשל האמריקאי לא יכול לתת אמון בראש רשות ביטחון שראש ממשלת ישראל הודיע שאין לו בו אמון, ממחישה את גודל הסכנה בהמשך כהונתו של ראש השב"כ בתפקידו".
אמיר הוסיף כי: "כפיית המשך כהונתו של ראש השירות בצו ביניים שיפוטי בשעה שהממשלה הביעה חוסר אמון מוחלט בהמשך הכהונה, כבר מציבה חשש ממשי לפגיעה ביחסי החוץ ובשיתוף הפעולה המודיעיני עם ישראל".
לעמדת הממשלה, "תקופת חסינות לראש השירות שבה מושעה ציוויו הברור של המחוקק המכפיף אותו למרות הממשלה, פוגעת באופן אנוש במימוש מטרותיו ומשימותיו של שירות הבטחון הכללי, כמו גם באתגרים מולם ניצבת מדינת ישראל".
בעמדת הממשלה ישנה התייחסות ישירה לפרשת ההדלפות מהשב"כ שנחשפה השבוע: "בימים שחלפו מיום הדיון נחשפה מדיניות מעצרים של שירות הבטחון הכללי של אזרחים ישראלים ללא ראיות ובהטיה מובהקת ותוך מעורבות של לשכת ראש השירות. החשיפה הובילה כבר להשעיית ראש החטיבה היהודית בשירות. דיוני הארכת מעצר של איש שירות אחר, חושפים חשש מפעולות הנעשות בניגוד עניינים, באכיפה בררנית העושה שימוש באמצעים דרקוניים המצויים בידי שירות הבטחון הכללי למטרות אישיות ובלתי ממלכתיות בעליל כל זאת, תוך המצאות ראש השירות במצב מובהק של ניגוד עניינים ותוך שקילת שיקולים זרים".
בממשלה הוסיפו: "הקלטות שפורסמו בימים האחרונים מעמידות את הודעת ראש השירות מיום לבית המשפט באור מביך במיוחד. יש להדגיש את המובן מאליו בהקשר הזה - מרות הממשלה אינה צמצום של הדמוקרטיה. היא מימוש של הדמוקרטיה. היא הבלם מפני פגיעה של השירות וראשו בדמוקרטיה. מי שאין עליו מרות של נציגי האזרחים, יש חשש ממשי שיפעל ללא בלמים נגד אזרחים ונגד ממשלתם".
בנוסף, טען עו"ד ציון אמיר בשם הממשלה כי "המשך כהונתו הכפויה של ראש השירות גורר את השירות לליבת הוויכוח הפוליטי ומרסק את מעמדו הממלכתי. כהונתו הכפויה של ראש שירות, הקורא בפומבי תיגר על הממשלה ועל סמכותה, גוררת את השירות ואנשיו הנפלאים, שלא ברצותם ושלא בטובתם, אל מחלוקת ציבורית ופוליטית. בכל יום שעובר, הנזק לקונצנזוס הציבורי החיוני לפעולת השירות, עלול להתגבש לכדי נזק בלתי הפיך".
"הממשלה הזהירה בדיון כי למשפט יש גבולות רצויים ויש לו גם גבולות מעשיים. גבול אחד שכזה הוא חוסר יכולתו של המשפט לכפות אמון ושיתוף פעולה במצבים של שבר בלתי הפיך. כפיית המשך כהונת ראש השירות על אף קריאת התיגר שלו על הממשלה והימנעותו המתריסה מלתת דין וחשבון בפניה, החמירה את חוסר האמון בו לשיאים חסרי תקדים", כתב אמיר.
יהודה פואה יו"ר בצלמו המייצג את הורי החטופים וההורים השכולים מסר: "המצב החדש שנוצר בעקבות הגלויים החדשים בפרשת בר-גייט הופכים את החסינות שהעניק בית המשפט לרונן בר לסכנה מוחשית לבטחון ישראל".