החקירה נוהלה תחילה באופן סמוי, תוך שימוש באמצעים טכנולוגיים מתקדמים, שבסיומה גובשה תשתית ראייתית נגד החשוד. ביום 19 באוגוסט הפכה החקירה לגלויה, עם מעצרו של הצעיר מכפר קאסם והבאתו לחקירה במשרדי היחידה.
במהלך החקירה נאספו ראיות נוספות נגד החשוד, לרבות שיטות הפעולה בהן נקט להכנת המטענים. לאחר סיום החקירה, הוגשה הצהרת תובע, ומחר צפויה פרקליטות מחוז מרכז להגיש נגדו כתב אישום חמור ובקשה למעצר עד תום ההליכים בבית המשפט המחוזי בלוד.