בתחקיר שפורסם ביוני בחדשות 12 נטען כי בן־שלוש גייס מאות אלפי שקלים לקמפיין בעזרת איש עסקים מקומי, שהבטיח לו ולמקורביו תפקידים בכירים. עוד נטען כי אותם מקורבים דאגו להביא מצביעים לקלפי ואף שילמו להם בעבור הצבעתם.
במרץ האחרון נעצר בן־שלוש יחד עם סגנו ו־12 חשודים נוספים במסגרת חקירת המשטרה בפרשת שוחד הבחירות. מעצרו הוארך בשישה ימים בבית משפט השלום בראשון לציון, אך לאחר מכן שוחרר וחזר לתפקידו. במקביל נמשכת חקירת המשטרה בחשד לעבירות של שוחד בחירות, קבלת דבר במרמה בנסיבות מחמירות, הפרת אמונים ועבירות נוספות.
בית המשפט הורה לקיים בחירות חדשות, אולם דחה את בקשת שגב להורות על העברתו המיידית של בן-שלוש מכהונתו. לפיכך יישאר בתפקידו עד למועד הבחירות הקרובות.
בהחלטתה ציינה השופטת פרי:"הוצגה תשתית לליקויים שנפלו בהליך הבחירות והוצגו ראיות לכך שהיו מצביעים שקיבלו תשלום עבור הצבעתם. עוד ציינה כי ישנם מצביעים שקיבלו הבטחות לאיוש משרות, וכן טיפול בהיתרי בנייה. השופטת הזכירה כי במקביל להחלטתה מתקיימת עדיין חקירה ביאח"ה באותו עניין ולכן מרבית הפרטים בערר יישארו חסויים בשלב זה".