שגיא היה אחד השופטים המוערכים במערכת המשפט, מקובל גם על סנגורים גם על פרקליטים. בכל פעם כשהיה תיק מורכב, היו הולכים אליו לגישור. כיהן במערכת המשפט כ-20 שנה. עתידו היה לפניו, ודובר על האפשרות בעתיד למנותו לשופט עליון. הוא גם מונה כנשיא המחוזי באר שבע לאחר שהתרשמו ממנו עמוקות כשופט בכיר במחוזי ת"א.
מהמשטרה נמסר כי על פי החשד רכב שעלה מהשטח פגע בשגיא, שרכב על אופנוע, וכתוצאה מהתאונה הוא נפגע במצב אנוש, כך לפי גורמי הרפואה שהגיעו למקום. זמן מה לאחר מכן, דיווחו במד"א כי הוא ללא סימני חיים ועם חבלה רב מערכתית, והם נאלצו לקבוע את מותו במקום. שוטרי תחנת קריית מלאכי ובוחני תאונות הדרכים החלו בחקירת נסיבות התאונה.
בהודעה שנשלחה לשופטי המחוז נכתב: "חברות וחברים שלום לכם, בצער עמוק אני נאלץ לכתוב לכם שחברנו, נשיא בית המשפט המחוזי בבאר שבע, השופט בני שגיא, נהרג אחר הצהריים בתאונת דרכים בכביש 6. כאשר נדע פרטים נוספים אעדכן. שמרו על עצמכם".
"הנשיא שגיא היה בעל יכולות ניהול יוצאות דופן ויחסי אנוש נדירים. כל אלה, לצד ידע מקצועי רחב, הקנו לו מעמד של סמכות מקצועית וניהולית, הן בקרב עמיתיו השופטים, הן בקרב עורכי הדין, והן בקרב כלל הציבור שנחשף לעשייתו. הנשיא שגיא יחסר מאוד למערכת המשפט בכלל, לבית המשפט המחוזי בבאר שבע בפרט, ולי באופן אישי. אני שולח תנחומים מעומק לבי למשפחתו, לחבריו ולעמיתיו. יהי זכרו ברוך".
"רק בשבוע שעבר התקשרתי לברך אותו לאחר שפורסם פסק דין ראשוני שנתן במסגרת חוק הפרוטקשן החדש, ושוחחנו ארוכות על חשיבות הטיפול בתופעה ומאפייניה. קיוויתי מאוד להמשיך ולראות בעלייתו מעלה מעלה אל ביהמ״ש העליון. השופט שגיא היה ידוע בכך שמגיע לעבודתו בבאר שבע כשהוא רוכב מהמרכז על אופנוע. לפני שעה קלה פורסם כי נהרג הערב בתאונת דרכים, ואני כואב ודואב מאוד על לכתו בטרם עת. אני שולח תנחומים מעומק הלב למשפחתו של האיש הנפלא הזה, ולחבריו. יהי זכרו ברוך ותהא מנוחתו עדן".
"בשנה וחצי האחרונות כיהן כנשיא בית המשפט המחוזי בבאר שבע, אליו הגיע מבית המשפט המחוזי בתל אביב, תפקיד אותו מילא במקצועיות רבה, תוך הפגנת כישורי מנהיגות מקצועיים ואישיים. נשיא בית המשפט העליון, מנהל בתי המשפט וכל שופטי ועובדי מערכת בתי המשפט משתתפים בצער המשפחה ומביעים תנחומים מעומק הלב לכל אוהביו ומוקיריו. על מועד ההלוויה תצא הודעה בהמשך. יהי זכרו ברוך".
"מעבר ליכולותיו המקצועיות המזהירות בלט ביכולתו להביא להסכמות בין הצדדים, לנהל ביעילות תיקים מורכבים ומערכת מורכבת כמו בית המשפט המחוזי. מעל הכל בני היה איש של אנשים וראיתי בו דמות לחיקוי והשראה ומועמד מושלם למלא את התפקידים הבכירים ביותר במערכת המשפט. לכתו הטרגי הינו אובדן עבור לשכת עורכי הדין ועבורי באופן אישי".
"יכולותיו הניהוליות, שיקול הדעת, והיחס האנושי שאפיין את עבודתו זיכו אותו בהערכה רבה מצד שופטים, עורכי דין והציבור הרחב. מותו הוא אבדה כבדה למערכת המשפט ולשירות הציבורי בישראל. משרד המשפטים שולח תנחומים מעומק הלב למשפחתו, לחבריו ולעמיתיו. יהי זכרו ברוך".
התרעות פיקוד העורף