העותרים ביקשו לבטל את החלטת הוועדה ולהורות על השבת הכספים, בטענה כי מדובר ב"הליך פסול, שלא איפשר לחברי הכנסת לקבל החלטה מושכלת", וכי הוצגה "תשתית עובדתית חסרה, מוטעית ומטעה".
יועמ"שית הכנסת מציינת כי לאחר בחינת הדברים התברר לה שרוב הכספים הועברו בפועל עוד לפני שהפנייה הובאה לאישור ועדת הכספים. לפי התגובה, "מרבית הכספים הכלולים בה כבר חולקו בפועל", וכי מדובר בהתנהלות ש"אינה חוקית".
עוד מדגישה הכנסת כי מידע זה לא הוצג לחברי הכנסת בזמן אמת. לדבריה, "חברי הכנסת כלל לא היו מודעים לה בעת שקיבלו הכרעתם", וכי גם במסמכים ובדיון לא ניתן היה להבין שמדובר באישור בדיעבד.
הכנסת מתארת כי גילתה את העובדות רק לאחר הגשת תגובת הממשלה לבית המשפט, וציינה כי היא "רואה את הדברים בחומרה רבה". במקביל פנתה למשרד האוצר לקבלת נתונים, אך לטענתה לא התקבל מענה מהותי, אלא "מכתב טכני ולקוני" בלבד.
לעמדת יועמ"שית הכנסת "אין כל מקום להסכין עם שיטת העבודה של משיבי הממשלה, אשר פנו לכנסת בבקשה לביצוע העברה תקציבית רק לאחר שמרבית הכספים הכלולים בה כבר חולקו בפועל. דרך התנהלות זו אינה חוקית, ומיותר לציין כי אינה מקובלת על הכנסת כלל ועיקר".
למרות הביקורת, הכנסת סבורה כי אין לבטל את ההחלטה במקרה זה. לפי עמדתה, הכספים כבר שולמו, בין היתר כשכר עובדים, ולכן "אין לדרוש מהעובדים להשיב את שכר העבודה ששולם להם".
בסיכום, הכנסת קובעת כי מדובר בהתנהלות לא חוקית מצד הממשלה, אך הפתרון צריך להיות צופה פני עתיד. לשיטתה, יש לקבוע כי לא ניתן יהיה עוד להעביר כספים לפני אישור ועדת הכספים, וכי פניות מסוג זה לא יאושרו בעתיד.
"מדובר בגניבה חמורה! הממשלה גנבה את כספי משלמי המיסים. הבג"ץ שלנו משנה את כללי המשחק. הם לא יוכלו להמשיך לגנוב את הכסף שלכם. יש עתיד תמשיך להלחם בשביל הציבור המשרת והעובד. עלינו אפשר לסמוך", מסר לפיד.