אם סיום החקירה הנגדית ב4000, תחל החקירה נגדית של הפרקליטות בתיק 2000 - (תיק שיחות נוני מוזס ונתניהו). בתיק זה העריך התובע עו"ד יונתן תדמור, המשנה לפרקליט המדינה, כי ידרשו לפרקליטות סדר גודל של שמונה ימי דיונים לחקור את נתניהו. לכשתסתיים החקירה של תיק 2000, תערך חקירה חוזרת של סנגורו של נתניהו. חקירה חוזרת היא בד"כ קצרה יחסית. אם מסכמים את כלל הדיונים לפרקליטות נדרשים 11 ימי עדות מלאים ולסנגורים עוד ימים.