במסגרת החקירה עצרו השוטרים, יחד עם כוחות צה"ל מחטמ"ר בנימין, שני קטינים פלסטינים החשודים במעורבות במעשה. מעצרם הוארך מעת לעת, ובתום ימי המעצר הושתו עליהם תנאים מגבילים. עוד במסגרת החקירה נחשפה זהותו של חשוד נוסף, וזה נעצר ביום ראשון האחרון על ידי השוטרים. החקירה נמשכת.
מעצרו של החשוד הוארך בשישה ימים, ובמשטרה מתכוונים לגבש תשתית ראייתית בעניינם של השלושה כדי למצות עמם את הדין. "משטרת ישראל רואה בחומרה פגיעה בסמלי המדינה, מעשי אלימות וגרימת נזק לרכוש, ותמשיך לפעול בנחישות ובמקצועיות לאיתור המעורבים, חקירתם ומיצוי הדין עמם", נמסר מהמשטרה.