אימו שהגיעה לשטח, ניסתה להאחז בתקווה שלא מדובר בבנה, אך מאוחר יותר הבינו בני המשפחה כי זוהי גופתו. לאחר נתיחת הגופה, היא הובאה לקבורה בעיר אילת, שם נמצאים חלק מקרובי משפחתו. שני חבריו שהיו עימו, עמרי פרץ ומקסים ברברמן, נחקרו כדי לנסות להבין מה קרה לו ונעצרו גם חמישה צעירים בחשד שהיו מעורבים בפגיעה בו, אך הם שוחררו לאחר מספר ימי חקירה.
נסיבות העדרותו ומותו של דיין, נחקרו בידי שלושה גופי משטרה: משטרת דימונה, חוקרים ממחוז המרכז וכן חוקרים מתחנת רמת השרון. המשטרה ספגה ביקורת נוקבת על הזמן שעבר עד שגופתו נמצאה, בין היתר משום שהיא נמצאה באזור שבו נערכו חלק מהחיפושים. האנשים שנחקרו בפרשה, ביניהם אלו שנעצרו, סיפקו מספר גרסאות לחוקרים, דבר שהקשה עוד יותר על התוויית המסלול שעבר עד שגופתו נמצאה.
לאחר שהחקירה הסתיימה, נותרו הרבה מאד שאלות פתוחות כשהראשונה בהן היא מה גרם למותו של דיין. שאלה נוספת קשורה לנתיב בו הוא עבר עד מציאת הגופה וכמובן האם יש אחריות אנושית למותו ומי נושא בה: "אופן ניהול החקירה בעניינו של אלדר, הוא בבחינת תעודת כישלון למשטרת ישראל", מסרה בשמם של בני המשפחה, עורכת הדין ספיר פרדו שמייצגת אותם.
"בני המשפחה הגיעו היום להפגין מול תחנת משטרת דימונה, שכן היא זו שהתרשלה ויצרה את המחדלים המהותיים והקשים ביותר בחקירת העניין והם אלו שהובילו לתוצאה ההרסנית, לקבל אותו בשקית. המשפחה תעשה הכל על מנת שתיפתח החקירה בעניינו של אלדר מחדש ובפרט לאחר שמטשרת ישראל עצמה הודתה בקיומם של מחדלים בחקירה. משטרת ישראל, שתפקידה להיות המסננת הראשונה בניהול החקירה וחקר האמתי, שיבשה את החקירה בעצמה ואין חמור מכך", הוסיפה.
במשטרה אומרים כי מרגע שהתקבלה ההודעה על העדרו התחילו בביצוע פעולות שנועדו לאתר אותו. יצוין עם זאת כי על פי הערכה, החיפושים החלו אחרי שהוא כבר לא היה בחיים.
התרעות פיקוד העורף