מכתב האישום עולה כי ביום האירוע, הנאשם פיתה במרמה את המנוחה להיכנס לרכבו והוביל אותה אל זירת הרצח בסמוך לכפר איבטין, שם המית אותה וקבר אותה. בעקבות תשעה ימים של מאמצי חיפוש, אותרה המנוחה.
כזכור, מפרטי החקירה עלה כי ספיר ירדה להפקיד את בתה בגן ילדים בעכו, ונראתה בבירור במצלמות האבטחה כשהיא עולה לרכבו של חלאילה - מאז נעלמו עקבותיה. במשך מספר ימים חיפשו כוחות משטרה גדולים אחר נחום.
אלא שבאמצעים טכנולוגיים מיוחדים הצליחו החוקרים של ימ"ר חוף, בפיקודו של סגן ניצב יוני חג'ג', להתחקות אחר הראיות, ויחד הם הפכו ראיה אחר ראיה, וגיבשו תשתית המצדיקה הגשת כתב אישום נגד חלאילה. במסגרת החקירה, נחשפה המשטרה לגרסאות שונות שמסר לכאורה החשוד. היא מכנה אותו כ"שקרן מניפולטיבי", והחשוד מבחינתו מסר למשטרה כי הוביל את הצעירה בטרמפ לקניון, אולם בדיקות שביצעו החוקרים והתחקות אחר מצלמות האבטחה בקניון העלו כי הם לא הגיעו למקום.