בפסק הדין צוין כי העתירה תידחה בשל הודעת משרד החינוך שהורתה להעביר את התלמיד למוסד חינוכי אחר בו יוכל ללמוד, אך ציין כי בקשת ההורים לא תואמת את חוק זכויות התלמיד, לפיו לא תהיה אפליה מטעמי נטייה מינית או זהות מגדרית.
"העתירה מועלית דרישה לביטול ההכרה בהתאמה המגדרית של התלמיד, אינה מתיישבת עם הוראות חוק זכויות התלמיד והוראת חוזר המנכ"ל עליהם עמדנו לעיל", נכתב בפסק הדין, "בנסיבות אלה גם אם אעניק משקל מופחת לטענות הסף, ואינני סבור שיש הצדקה להתערבות בית המשפט במחלוקת שנפלה בין העותרים לבין רשויות החינוך השונות".