משרד הביטחון ממשיך בהערכות לקראת יום הזיכרון לחללי מערכות ישראל תשפ"א 2021, כאשר למרות השיפור הדרמטי במצב התחלואה בקורונה, עדיין יוטלו גם ביום הזיכרון הזה מגבלות מסוימות, ובמשרד הביטחון מדגישים כי ביום הזיכרון תתאפשר ההגעה של המשפחות השכולות בלבד לבתי העלמין, והציבור מתבקש לכבד את המשפחות השכולות ולאפשר להן להגיע לבתי העלמין ולהתייחד עם זכר יקיריהן תוך שמירה על בריאותן.

כמו בכל שנה רגילה, את המשפחות יקבלו בבתי העלמין נציגי אגף המשפחות, וחיילי צה"ל יניחו דגלונים, זרי פרחים ונרות נשמה על קברי החללים. את הציבור הרחב מזמין משרד הביטחון לפקוד את בתי העלמין במה שמוגדר "שבוע הזיכרון", החל מתאריך ה-9 באפריל ועד ה-13 באפריל, ערב יום הזיכרון עצמו. טקסי ערב יום הזיכרון ייערכו השנה בנוכחות קהל, זאת בהתאם להנחיות משרד הבריאות ולכללי התו הירוק. 

לקראת ימי הזיכרון ביקר היום שר הביטחון, בני גנץ, באתר הזכירון הממלכתי בהר הרצל ואמר: "השנה נפתח את בתי הקברות, והדגש הוא לתת אפשרות למשפחות השכולות בלבד להגיע הקברות. אני מקווה כי בתקופה פוליטית כזו נשמור את הזיכרון מעבר לכל פוליטיקה, ואני מאמין שכך יהיה". 

את קמפיין ההסברה לציבור והקריאה להדלקת נר זיכרון וירטואלי יוביל השנה הזמר שלומי שבת, והקמפיין יתמקד השנה בקריאה לציבור (מלבד המשפחות השכולות) להגיע לבתי העלמין במהלך שבוע הזיכרון ולא יום הזיכרון עצמו. בנוסף יקרא שלומי שבת בקמפיין שיושק במוצאי שבת הקרוב להדליק נר זיכרון וריטואלי באתר יזכור, לכתוב הקדשות ולצרף הקדשה למשפחת הנופל, כאשר השנה לראשונה ההקדשות תהיינה פומביות.

אריה מועלם, סמנכ"ל וראש אף משפחו שכולות הנצחה ומורשת במשרד הביטחון, אמר: "גם השנה אנחנו מציינים את יום הזיכרון בצל הקורונה. ההיערכות ליום הזיכרון נעשתה תוך איזון בין התחשבות ברגשי הציבור, המשפחות השכולות ושמירה על הנחיות הקורונה. בימים הקרובים יחלו עובדי האגף לפנות באופן יזום לכל המשפחות השכולות ולעדכן אותן בפרטי ההיערכות". 

בהתאם להנחיות הקורונה טקס הצדעה לנופלי מערכות ישראל והנחת דגל הלאום על קברי החללים יתקיים ביום ראשון 11.4 בשעה 11:30 בהיכל הזיכרון שבהר הרצל, בראשות חמשת ראשי גופי הביטחון: רמטכ"ל, ראש שב"כ, ראש מוסד, מפכ"ל ונציבת שב"ס. טקס יום הזיכרון בבית יד לבנים בירושלים שנערך בדרך כלל זמן קצר לפני כניסת ערב יום הזיכרון יתקיים בשעה 16:30 במעמד ראש הממשלה ויושב ראש הכנסת בטקס ישתתפו עד 350 אנשים. בערב יום הזיכרון, הטקס הממלכתי שנערך ברחבת הכותל יתקיים במעמד נשיא המדינה והרמטכ"ל ובהשתתפות של עד 500 משתתפים. בטקס הממלכתי בהר הרצל ביום הזיכרון תוגבל הכניסה לרחבת הטקס ל-200 איש בלבד