בהודעה הקצרה שנמסרה מטעם משרד הביטחון נמסר כי "נציגים ממספר גופים הגיעו לחברת NSO לבדיקת הפרסומים והטענות שהועלו בעניינה". ככל הנראה, הגופים שעורכים את הבדיקה ממשרד הביטחון הם אגף הפיקוח על הייצוא והמלמ"ב, שבסמכותו גם לנהל חקריה במידת הצורך.
מוקד הבדיקה והבחינה של אותם גופים הוא לבדוק האם החברה פעלה בהתאם להיתרים והסמכויות שניתנו לה מאגף הפיקוח על הייצוא במשרד הביטחון. לצד זאת, בכירים לשעבר במודיעין טוענים כי במידה ויתברר כי החברה פעלה בהתאם להיתרים המדינה צריכה לתת להם הגב ולתמוך בה.
יחד עם זאת, טוענים בכירים אחרים כי לא מפסיק בפרשה כזו לבדוק רק את התנהלות החברה וצריך לבחון גם את ההתנהלות בתוך משרד הביטחון שאינו מסוגל לחקור את עצמו.
התרעות פיקוד העורף