דילמת שיחרור המחבלים הכבדים: בניגוד לדרישה הישראלית לכך שהמחבלים הכבדים ישוחררו מבתי הכלא ויגורשו לחו״ל במערכת הביטחון מעדיפים שדווקא המחבלים הכבדים יועברו לשטחי איו״ש ולעזה. הסיבה יכולת הפיקוח של השב״כ ואמ״ן על המחבלים ולמנוע מהם לשקם את חמאס. 

במסגרת ההסכם רשימת המחבלים שישוחררו יהיו בתמהיל כאשר חלק לאיו״ש ולרצועת עזה וחלקם יגורשו לחול כאשר חלק מהמדינות שעשויות לקלוט את המגורשים הן תורכיה וקטאר. מקום משבם של הנהגת חמאס חו״ל. ההבנה במערכת הביטחון כי חלק לא קטן מהמחבלים המוגדרים ״כבדים״ מתכוונים לשמר ואף למנף את מעמדם בתוך החמאס. העובדה כי הנהגה של החמאס חסרה לאחר חיסולו של יחיא סינוואר, מוחמד דף וכן מחמוד עיסא אשר חוסלו על ידי השב״כ וצה״ל בלחימה בעזה. ההערכה במערכת הביטחון כי חלק מהמשוחררים. יבקשו להיכנס ולמלא את משבצות ההנהגה של החמאס החשש כי הם עשויים לאתגר את ישראל על ידי בניה מחודשת של הכוח הצבאי של חמאס. 

שחרור מחבלי חמאס מכלא עופר בעסקת החטופים בנובמבר (צילום: ג'מאל עוואד, פלאש 90)
שחרור מחבלי חמאס מכלא עופר בעסקת החטופים בנובמבר (צילום: ג'מאל עוואד, פלאש 90)

העניין שאם ההנהגה תפעל בשלט רחוק מתורכיה או מקרטר הדבר יקשה על השב״כ ואמ״ן לפקח עליהם אבל יותר מזה הדבר יקשה לסכל אותם כשישראל תחליט על כך. גורמים במערכת הביטחון אומרים אין ספק לגבי העובדה שמחבלים משוחררים באיוש יהיו מאתגרים ביטחונית, אבל מבחינת נגישות של מערכת הביטחון יהיה הרבה יותר נגיש לטפל בהם. ה-BCC אישר כי חמאס מנסה להוסיף אסיר בכיר אחד או שניים לרשימת האסירים הצפויים להשתחרר במסגרת השלב הראשון.