המודיעין הוא המידע האחרון המציע תמונה מורכבת יותר מזו שהעביר הנשיא, שאמר כי המבצע "מחק לחלוטין" את תוכנית הגרעין של איראן. ממשל טראמפ לא חלק על קיומן של השיחה שיורטה, שלא דווחה בעבר, אך חלק בתוקף על מסקנות האיראנים והטיל ספק ביכולתם להעריך את הנזק בשלושת מתקני הגרעין.
אך היקף ההרס וכמה זמן ייקח לאיראן לבנות מחדש נידונים על רקע הדיווחים לפיהם איראן הזיזה את מלאי האורניום המועשר שלה לפני התקיפה והפיצוצים אטמו את הכניסה לשניים מהמתקנים אך לא גרמו לקריסתם של המבנים התת-קרקעיים שלהם.
כשנשאל על השיחה שיורטה, אמר גורם בממשל טראמפ כי האיראנים "טעו כי הרסנו את מתקן המרת המתכת שלהם. אנו יודעים שהנשק שלנו סופק בדיוק לאן שרצינו שיסופק והיה להם האפקט שרצינו".
המתקן, שהוא המפתח לבניית ליבת חומר הנפץ של הפצצה, ייקח שנים לשקם, אמר הגורם. רטקליף אמר גם כי קהילת המודיעין האמריקאית מעריכה כי "הרוב המכריע" של האורניום המועשר של איראן "קבור ככל הנראה באספהאן ובפורדו".
לאחר שהוושינגטון פוסט ביקש תגובה ממשרד ראש המודיעין הלאומי, אמר גורם בכיר במודיעין האמריקאי כי "פרוסה אחת של מודיעין אותות בפני עצמה אינה משקפת את תמונת המודיעין המלאה. שיחת טלפון אחת בין איראנים אנונימיים אינה זהה להערכת מודיעין, אשר לוקחת בחשבון גוף ראיות, עם מקורות ושיטות מרובים", אמר הגורם.
שיחות טלפון, מיילים ותקשורת אלקטרונית אחרת, המכונה מודיעין אותות, הן בין הכלים החזקים ביותר במאגר של סוכנויות הריגול האמריקאיות, ולעתים קרובות מהוות את רוב המודיעין בתדרוך המודיעיני היומי של טראמפ. אך למודיעין אותות יש גם מגבלות, שכן קטעי שיחות שנשמעו לפעמים חסרים הקשר ויש לשלב אותם עם מידע אחר לקבלת תמונה מלאה יותר של האירועים.
טראמפ זעם על סיקור חדשותי שסטה מטענותיו בנוגע למשימת ההפצצה, שקדמה להפסקת אש בין איראן לישראל שסיימה 12 ימי לחימה: "הדמוקרטים הם אלה שהדליפו את המידע", כתב ב-Truth Social, בהתייחסו להערכה ראשונית של סוכנות המודיעין של הפנטגון לפיה התערבותו של טראמפ ככל הנראה עיכבה את תוכנית הגרעין של איראן בחודשים, לא בשנים. "יש להעמיד אותם לדין!"
טראמפ גם הטיל ספק בדיווחים לפיהם מלאי האורניום הוזז, ואמר במהלך ראיון מוקלט מראש עם פוקס ניוז: "אני לא חושב שהם עשו זאת, לא. זה מאוד קשה לעשות; זה מאוד מסוכן לעשות... הם לא ידעו שאנחנו מגיעים עד אז".
"אי אפשר להפציץ ידע ולחסל אותו מהקיום - לא משנה כמה מדענים הורגים", הוסיף מרפי. "עדיין יש אנשים באיראן שיודעים איך להפעיל צנטריפוגות. ואם עדיין יש להם אורניום מועשר ועדיין יש להם את היכולת להשתמש בצנטריפוגות, אז אתם לא מעכבים את התוכנית בשנים. אתם מעכבים את התוכנית בחודשים".
"השאלה האמיתית היא, האם מחקנו את רצונם להחזיק בנשק גרעיני", אמר גרהם לכתבים. "אני לא רוצה שאנשים יחשבו שהאתר לא ניזוק קשות או הושמד. הוא אכן נמחק. אבל עם זאת, אני לא רוצה שאנשים יחשבו שהבעיה נגמרה, כי היא לא נגמרה".
גורם אמריקאי המעורה בתדרוך הסגור של הממשל למחוקקים אמר כי רטליף, ראש ה-CIA של טראמפ, הדגיש את הרס ההגנה האווירית של איראן על ידי הישראלים לפני המבצע האמריקאי כדי לטעון כי "הרעיון שהם יכולים בקלות לבנות מחדש כל דבר הוא מגוחך".
מבקרי החלטתו של טראמפ להשתמש בכוח צבאי טוענים כי הוא חמק מהסיכוי לפתרון דיפלומטי, שהוא הדרך היחידה להקים משטר פיקוח כדי להגביל ולנטר את תוכנית הגרעין של איראן. ייתכן שטהראן נוטה יותר לרוץ לעבר פצצה כביטוח מפני כל מאמצי שינוי משטר עתידיים מצד וושינגטון או ישראל.
במקביל, משרד החוץ האיראני מסר כי: "אנו מגנים בתוקף את הצהרותיו המגוחכות של טראמפ ואת התנהגותו הלא הולמת נגד המנהיג והעם האיראני".