כתוצאה מהפיצוץ נפצעו חמישה ובהם מפקד הגדוד וצוות החפ"ק שלו. כוחות שהיו בסמוך נחלצו לסייע לנפגעים, מסוקים של חיל האוויר פינו את הנפגעים לבתי חולים במרכז הארץ.
כמו כן, חייל בן 19 נפצע קשה מפגיעת מעלית בבסיס הקריה בתל אביב, בכניסה ל"בור" של מטה חיל האוויר. החייל פונה לקבלת טיפול רפואי בבית חולים איכילוב ומשפחתו עודכנה. בעקבות האירוע נפתחה חקירה של המשטרה הצבאית החוקרת, עם סיומה יועברו הממצאים לבחינת הפרקליטות הצבאית.
התאונה אירעה סמוך לשעה אחת בצהריים. חוקרי מצ"ח ומפקדים בחיל האוויר מנסים להבין כיצד אירעה התאונה הקשה. הערכה כי תקלה טכנית הובילה לקריסה של המעלית, אך לא ברור מדוע מערכות ההגנה והבטיחות לא עצרו את המעלית בקריסה מטה.