ראש הממשלה דאז, נפתלי בנט, עודכן באופן רצוף על פעולות החקירה והסיכול של חוליית הטרור, והנחה את שב"כ ואת רשויות אכיפת החוק לפעול בכל האמצעים הנדרשים על מנת לשים יד על כל מי שיאיים על אזרחי ישראל.
מהחקירה בשב"כ עלה כי חוליות אלו פעלו בהובלת רשיד רשק, פעיל חמאס בולט תושב העיר העתיקה בירושלים, אשר במקביל לפעילותו זו, תכנן יחד עם מנצור צפדי, פעיל חמאס מאבו תור, פיגוע ירי או התאבדות בירושלים. בנוסף, התברר בחקירה בשב״כ כי חברי החולייה תכננו להסתתר בחברון או בג'נין לאחר מימוש הפיגועים אותם תכננו.
עוד עלה כי רשק הקים מערך של פעילים בירושלים שמטרתו ביצוע הפרות סדר בשכונות מזרח העיר ובהר הבית במהלך חודש רמדאן האחרון, במטרה לערער את היציבות בהר הבית ובירושלים. בתוך כך, העבירו הפעילים זיקוקים רבים וכן דגלים וסרטי חמאס לשכונות מזרח העיר ולהר הבית לשימוש בעת הפרות הסדר במהלך חודש הרמדאן.
בבוקר 7 באוקטובר כתב סמאח אל עוברה מרהט לנסאסרה כי ברצונו להיענות לפניית מוחמד דף, שכל מי שיש ברשותו נשק - ייצא להילחם. נסאסרה השיב לו כי עליהם להתאזר בסבלנות והשניים הביעו שמחה ושביעות רצון מהאירועים והם העבירו ביניהם תמונות של מחבלי חמאס בתוך ישראל. בהמשך גייס נסאסרה לארגון גם את הנאשמים סמאח, חמזה גית מרהט ויוסף אבו הולי מלוד.
הנאשמים פעלו על מנת להכין מתווי פיגועי טרור שונים, ובין היתר תכננו פיגוע משולב בקרית ארבע, במסגרתו תכננו נסאסרה וסעוד אבו לבן לפרוס רשת מטעני חבלה ברחבי המקום, ולבצע פיגוע ירי. הם תכננו לברוח לאחר הירי, תוך הפעלת מטעני החבלה על אנשי כוחות ההצלה ושאר המתקהלים שיהיו במקום, במטרה להרוג כמה שיותר מהם. במסגרת זו, תכננו השניים לרצוח גם את השר בן-גביר, המתגורר בעיר, באמצעות ירי טיל RPG שניסו להשיג. כמו כן, במהלך יום העצמאות תכננו הנאשמים לבצע פיגועים בחיפה, בשדה התעופה בן גוריון ובקרית הממשלה בירושלים.
בנוסף תכננו פיגוע חטיפה של אזרח ישראלי במטרה לנהל משא ומתן לשחרור אסירים ביטחוניים; לתקוף בסיסים שונים ברחבי הארץ בהם הקריה, נבטים, צאלים, מחנה נתן ועוד. כמו כן הם תכננו לפגוע במתקן של חברת רפאל, לחטוף דרוזים מהגליל ולחטוף אוטובוס של חיילים מהתחנה המרכזית בבאר שבע לעזה.