בצה"ל מבינים כי הספינות של הצי הספרדי והאיטלקי המלוות את הסירות, לא מתכוונות לחצות ולהיכנס למים הטריטוריאליים של ישראל והן לא מתכוונות למנוע את מעצר הסירות בכניסה לשטח ישראל. "הספינות מלוות וייתנו סיוע אם אחת הסירות בדרך תיקלע למצוקה בלב ים. הם לא מתכוונים להיכנס לעימות מול חיל הים", אמר גורם צבאי.
על פי התוכנית של צה״ל. לוחמי הקומנדו הימי יעצרו את הספינות שיתקרבו למים של ישראל, בכל פעם קבוצה אחת של ספינות וזאת על פי קצב ההתקדמות שלהן. חיל הים יאפשר להן להסתובב ולצאת מהשטח הימי הישראלי, כאשר במידה ויסרבו, יעלו עליהן לוחמי השייטת שיבצעו השתלטות. במידה ותהיה התנגדות, חיל הים ישתמש באמצעי אל הרג כמו גז פלפל או במקרים שבהם תהיה סכנה לחיי הלוחמים, יופעל גם נשק חם. ההערכה בחיל הים היא שהספינות הראשונות יגיעו במהלך ליל כיפור.