בפסק הדין קבע בג"ץ כי אין מחלוקת לגבי הצורך בהקמת ועדת חקירה, וכי על הממשלה לעדכן בתוך 30 יום באשר להקמתה. בעקבות כך, טוענת הסנגוריה הצבאית כי המשך הליכי הביקורת שמנהל מבקר המדינה עשוי לפגוע בעבודת הוועדה שתוקם ולחבל בתקינות ההליך.
במכתבה למבקר המדינה נכתב: "משמעות ההתפתחויות האחרונות בזירה הצבאית-מדינית והחלטת בית המשפט העליון היא ברורה: תוקם ועדת חקירה לחקר אירועי ה-7 באוקטובר 2023 ומלחמת 'חרבות ברזל' בטווח הזמן הקרוב, ואף המיידי. השאלה אפוא אינה אם תוקם ועדה, אלא רק מה יהיה מנגנון החקירה שייקבע".
הסנגוריה הדגישה כי נוכח החלטת בית המשפט, החשש שהליכי ביקורת מקבילים יסכלו את עבודת ועדת החקירה "הפך מתאורטי לממשי ומוחשי". לדבריה, עדויות שיועברו למבקר המדינה, חשיפת מסמכים וטיוטות דוחות – עלולות "לזהם את התשתית העובדתית" ולפגוע בזכויות המבוקרים באופן בלתי הפיך.
התרעות פיקוד העורף