בבוקר מתקפת הפתע פעל בגזרה כוח מגדוד 934 של חטיבת הנח"ל. בשעה 05:30 נפרסו הכוחות במסגרת "כוננות עם שחר" בהתאם לפקודות ולהערכת המצב. לוחמי ומפקדי הגדוד נלחמו בגבורה ופגעו במחבלים רבים, אך ריבוי הקרבות ונפגעים במערכת הפיקוד והשליטה פגעו ביכולתם להגן על המושב.
בשעה 06:29 פתח חמאס בירי תלול-מסלול מאסיבי לעבר כל יישובי הנגב המערבי, ובהם מושב יתד והבסיסים הצבאיים במרחב. בחסות הירי חדרו המחבלים לשטח ישראל באמצעות כלי רכב וברגל. בתוך זמן קצר, הגזרה כולה הייתה מותקפת באופן מתוכנן כאשר הכוחות בשטח נמאים בחיסרון מספרי מובהק. 11 מחבלים השתתפו בהתקפה על המושב. עשרה מהם נכנעו ונעצרו על ידי כיתת הכוננות וכוח הגנת מושב יתד, בעוד לוחם צה"ל במילואים נפל בקרב בכביש 232. הקרב בפיקוד מח"ט פארן בכביש זה מנע הגעת מחבלים נוספים ובלם את התרחבות ההתקפה.
מסקנות התחקיר מצביעות על כך כי צה"ל נכשל במשימת ההגנה על מושב יתד. עם זאת, לוחמי כיתת הכוננות ותושבים נוספים פעלו במהירות ובאחריות מרשימה, חתרו למגע ונטרלו ועצרו את המחבלים - מנעו פגיעה בתושבי המושב. לפי התחקיר, הרבש"ץ וכוח הגנת המושב קיבלו החלטות נכונות ופעלו כמצופה מהם בבוקר ה-7 באוקטובר, ורוח ההתנדבות של תושבים שאינם חלק אורגני מכוחות ההגנה ראויה לציון.
בתחקיר צוין כי בשעות הבוקר המוקדמות נפגעה שרשרת הפיקוד מרמת הפלוגה ועד החטיבה הדרומית - מה שפגע ביכולת לגבש תמונת מצב מתואמת ולהפעיל הגנה מסודרת על המושב. עם זאת הובהר בתחקיר כי פעילות אוגדה 80 תרמה משמעותית ללחימה במושב, זאת על אף הזמן הממושך שלקח לכוחות האוגדה להגיע למושב - שעות הלילה עקב הלחימה העצימה במוקדים נוספים באותו היום.